pca ， nmds , pcoa 圖添加分組的橢圓
對於pca , nmds, pcoa 這些排序分析來說，我們可以從圖中看出樣本的排列規則，比如分成了幾組。 為例樣本分組更加的直觀，我們可以根據實驗設計時的樣本分組情況，對屬於同一個group的樣本添加1個橢圓或者其他多邊形。 新版本的ggplot2 中提供了stat_ellipse ...
原文：PCA和PCoA
講解很詳細：http: blog.genesino.com PCA PCA分析一般流程： 中心化 centering， 均值中心化，或者中位數中心化 ，定標 scale，如果數據沒有定標，則原始數據中方差大的變量對主成分的貢獻會很大。 根據前面的描述，原始變量的協方差矩陣表示原始變量自身的方差 協方差矩陣的主對角線位置 和原始變量之間的相關程度 非主對角線位置 。如果從這些數據中篩選主成分，則要 ...
2018-10-28 14:40 0 4099 推薦指數：
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