1)集合子集 對於給定的集合S={1,2,3},求其所有子集。LintCode 一種通常的做法是:對於集合中的任意一個元素e,有兩種可能:被選中作為子集中的元素,或否。因此,一個包含N個元素的集合,共有2^N個子集。如上例,其所有子集如下: s0={}, s1={1}, s2={2}, s3 ...
.基本概念 大部分的二倍體細胞,比如人類體細胞,擁有兩份基因組,一份來自於父親,另一份來自於母親,每一份基因組大概有 億個鹼基。 在不同個體中,基因組的鹼基內容大部分是相同的,只有少部分是不同的,這些不同的就成為SNP 單核苷酸多態性 。 在某一個鹼基上,如果來自父本和母本的鹼基不同時,則稱該區域為雜合子 Heterozygous 。由於個體的體細胞染色體基本上時配對的,這給雜合子的存在提供了可 ...
2018-04-18 10:09 0 1584 推薦指數:
1)集合子集 對於給定的集合S={1,2,3},求其所有子集。LintCode 一種通常的做法是:對於集合中的任意一個元素e,有兩種可能:被選中作為子集中的元素,或否。因此,一個包含N個元素的集合,共有2^N個子集。如上例,其所有子集如下: s0={}, s1={1}, s2={2}, s3 ...
雜合度計算分為兩種:位點雜合度和樣本雜合度 1、計算位點雜合度,測試數據如下: 2、--hardy計算位點雜合度 2、--het 計算樣本雜合度 首先要剔除沒有多態的位點: ...
面向組合子 面向組合子(Combanitor-Oriented),是最近幫我打開新世界大門的一種pattern。緣起haskell,又見monad與ParseC,終於ajoo前輩的幾篇文章。自去年9月起正式回歸C#以來,我又逐漸接受了不少新的paradigm(雖然主要原因還是在學 ...
1、測試數據 2、計算觀測雜合度和期待雜合度 ...
如下圖片所示: 對於位置為48245131的allele來說,REF為A,ALT為C 想確定變異到底是純合還是雜合,即兩條染色體是否同時發生了變異,則看GT,GT對應的數值為0/1,說明該變異為雜合; 如果GT對應的數值為0/0,說明該變異為純合。 ...
引用來自http://www.cnblogs.com/wuyiqi/archive/2012/03/12/2391960.html的思想; 首先有一個有向連通圖,每個點帶有一個權值,例如: ...
在測序一個新物種時,首先需要對該物種的基因組結構有所了解,包括以下幾個內容: 基因組大小 重復片段大小 雜合度大小 基因組越大,雜合度也大,重復片段越大,該物種的組裝難度就越大。通常我們會通過genome survery分析,對以上幾個指標 ...
《Fish and Scales》 作者:埃舍爾 本系列文章目錄: 一:前言及基礎 二:推斷 FIX、g 的類型 三:實現 Y 組合子 四:實現 Θ 組合子 五:推導裝配腦袋的 Fix ...