原文:lncRNA表達定量方法評估

見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA Seq of Cancer Samples Overall, of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense and lincRNAs the two most abundant categories. lncRNA的兩大類要知道。 ln ...

2018-03-27 15:42 0 881 推薦指數:

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Annotated LncRNA的實時定量PCR引物設計教程

LncRNA設計原則 LncRNA的引物設計跟mRNA的引物設計類似,都遵循以下規則: 1.引物應在核酸系列保守區內設計並具有特異性。2.擴增產物長度在 80-150bp。最長不要超過 300bp。3.產物不能形成二級結構(自由能小於 58.61KJ/mol)。4.引物長度:一般在 17-25 ...

Fri Jan 03 04:26:00 CST 2020 0 5984
Novel LncRNA的實時定量PCR引物設計教程

Novel LncRNA的選擇 novel LncRNA選擇的原則: 1.不能選與其他基因exon重疊的lncRNA,否則,RT-qPCR結果就混合了兩個基因的表達量。 2.最好選擇基因間的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因沒有重疊。 3.其次選擇位於其他基因intron區域 ...

Fri Jan 03 07:29:00 CST 2020 0 3099
[方法] 如何做產品的定量分析研究

定義 定量分析是通過對大量樣本、數據等客觀數據對用戶的特征、需求場景、目標、行為進行研究分析的過程。 為什么要進行定量分析 定量分析可以快速地面對更多、更廣的用戶,因此可以用於在定性研究中發現的問題和用戶需求(判斷用戶需求的真偽),讓定性需求更有說服力; 定量分析可以用來確定 ...

Mon Sep 06 01:45:00 CST 2021 0 106
bedtools 定量表達:coverage 統計 reads 數(加-sorted參數)

最近做定量表達,使用了命令如下: bedtools coverage -a all.bed -b file.sort.bam > file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多時候會出現Bus error或者Killed的報錯;能不能正常運行,很大程度上取決於系統的資源 ...

Tue Feb 15 05:12:00 CST 2022 0 1473
lncRNA分析

目前人們對lncRNA認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而大量研究表明,lncRNA在細胞核內、核外,通過染色質修飾,轉錄調控,轉錄后調控等多種方式調節基因表達,在腫瘤發生發展中具有重要作用 ...

Fri Jul 10 01:30:00 CST 2020 0 973
lncRNA研究

------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ...

Sat Aug 22 07:21:00 CST 2015 0 4418
 
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