LncRNA設計原則 LncRNA的引物設計跟mRNA的引物設計類似,都遵循以下規則: 1.引物應在核酸系列保守區內設計並具有特異性。2.擴增產物長度在 80-150bp。最長不要超過 300bp。3.產物不能形成二級結構(自由能小於 58.61KJ/mol)。4.引物長度:一般在 17-25 ...
見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA Seq of Cancer Samples Overall, of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense and lincRNAs the two most abundant categories. lncRNA的兩大類要知道。 ln ...
2018-03-27 15:42 0 881 推薦指數:
LncRNA設計原則 LncRNA的引物設計跟mRNA的引物設計類似,都遵循以下規則: 1.引物應在核酸系列保守區內設計並具有特異性。2.擴增產物長度在 80-150bp。最長不要超過 300bp。3.產物不能形成二級結構(自由能小於 58.61KJ/mol)。4.引物長度:一般在 17-25 ...
Novel LncRNA的選擇 novel LncRNA選擇的原則: 1.不能選與其他基因exon重疊的lncRNA,否則,RT-qPCR結果就混合了兩個基因的表達量。 2.最好選擇基因間的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因沒有重疊。 3.其次選擇位於其他基因intron區域 ...
featureCounts真的很厲害。 常見的參數(沒什么好說的,畢竟是固定的): -a -o input_file1 -F -t -g -Q -T 關鍵是以下幾個參數怎么設 ...
https://blog.csdn.net/hustqb/article/details/77922031 評分參數定義模型評價規則 ...
定義 定量分析是通過對大量樣本、數據等客觀數據對用戶的特征、需求場景、目標、行為進行研究分析的過程。 為什么要進行定量分析 定量分析可以快速地面對更多、更廣的用戶,因此可以用於在定性研究中發現的問題和用戶需求(判斷用戶需求的真偽),讓定性需求更有說服力; 定量分析可以用來確定 ...
最近做定量表達,使用了命令如下: bedtools coverage -a all.bed -b file.sort.bam > file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多時候會出現Bus error或者Killed的報錯;能不能正常運行,很大程度上取決於系統的資源 ...
目前人們對lncRNA認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而大量研究表明,lncRNA在細胞核內、核外,通過染色質修飾,轉錄調控,轉錄后調控等多種方式調節基因表達,在腫瘤發生發展中具有重要作用 ...
------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ...