原文:R語言 vegan包計算物種累計曲線

vegan 包是進行群落數據分析最常用的R包,其中的 specaccum 函數用來計算物種的累計曲線 首先看下官方示例: 出來的結果圖如下: 那么這幅圖表明了什么含義呢 首先看下輸入數據 我們簡單的看一下BCI這個數據,它的每一行代表了一個樣本,不同樣本采樣的地點不同,每一列是 個物種的豐度 最終的物種累計曲線中,橫坐標是樣本個數,縱坐標是發現的物種個數,隨着樣本個數的增加,發現的物種個數也不斷增 ...

2017-11-14 15:12 0 3847 推薦指數:

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安裝R語言擴展vegan

這周的作業我開始得好遲啊。。。然而還是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌噠分割線×××××××××××××××××××××××××××××××××××× 首先,百度進入官方頁面,看到這些: 也就是說,需要先安裝permute和lattice。那么,如何安裝 ...

Sat Nov 05 03:49:00 CST 2016 0 4301
R語言繪制KS曲線

更多大數據分析、建模等內容請關注公眾號《bigdatamodeling》 將代碼封裝在函數PlotKS_N里,Pred_Var是預測結果,可以是評分或概率形式;labels_Var是好壞標簽,取值為 ...

Wed May 23 20:24:00 CST 2018 0 1263
vegan 進行Adonis 分析

Adonis 分析 是基於距離矩陣的多變量方差置換分析, 代碼示例: 默認使用bray 距離來計算樣本間的距離矩陣 參考資料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics ...

Mon Dec 18 18:51:00 CST 2017 0 2452
vegan 進行 Bioenv 分析

Bioenv 分析通過 計算樣本群落結構的距離矩陣和 環境因子的距離矩陣,計算兩個距離之間的相關系數,挑選出最佳的環境因子組合; 默認情況下,計算 群落結構的距離矩陣時, 使用 Bray-Curtis 距離; 計算環境因子的距離矩陣時,使用Euliodean 歐式距離 ...

Fri Dec 15 23:44:00 CST 2017 0 1936
R語言曲線

本文以1950年到2010年期間我國的火災統計數據為例,數據如下所示: (0)加載數據 data<-read.csv("E:\\MyDocument\\p\\Data\\1950~20 ...

Wed Jan 07 05:42:00 CST 2015 0 25220
R語言畫正弦曲線

正弦曲線一個周期是2π,我們要先生成x的取值范圍。 可以用seq函數生成一個等差序列,步進為0.01 x=seq( 0, 2*pi, 0.01 ) pi表示π y=sin(x) plot(x,y,type='l') type='l'表示圖形顯示為線段,line ...

Fri Jul 15 18:54:00 CST 2016 0 3040
 
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