原文:xgene:WGS,突變與癌,RNA-seq,WES

人類全基因組測序 SNP single nucleotide polymorphism :有了 倍以上的覆蓋深度以后,來確認SNP信息,就相當可靠了。 一個普通黃種人的基因組,與hg 這個參考基因組序列相比,會有 萬個左右的SNP。又有大概 萬個是落在外顯子上的,而非同義的SNP有大概 千個。 所謂非同義的SNP,就是這些SNP是會引起蛋白質的序列變化的。 indel: insertion am ...

2017-09-03 11:41 0 1585 推薦指數:

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什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
簡單理解RNA-seq

簡單理解RNA-seq 劉小澤 已關注 2018.10.17 23:51* 字數 1518 閱讀 46評論 0喜歡 3 今天就當一個小故事看吧,看了statQuest,感覺講的很棒,於是分享給大家原版視頻后台回復 ...

Sat Oct 20 04:27:00 CST 2018 1 1989
RNA-seq(9):功能富集分析

這部分開始進行基本的富集分析,兩類 A:差異基因富集分析(不需要表達值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有無差異, ...

Sat Dec 15 19:18:00 CST 2018 0 1543
轉錄組測序(RNA-seq)技術

轉錄組是某個物種或者特定細胞類型產生的所有轉錄本的集合。轉錄組研究能夠從整體水 平研究基因功能以及基因結構,揭示特定生物學過程以及疾病發生過程中的分子機理,已廣泛應 用於基礎研究、臨床 ...

Sun May 12 00:18:00 CST 2019 0 1336
RNA-seq 數據的簡單分析

主要介紹如何分析RNA-seq 數據 參考文檔 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...

Fri Oct 09 04:56:00 CST 2015 0 11048
RNA-Seq分析——KEGG富集分析

入學到現在已經有小半年了,最近正好在做RNA-Seq的分析,記錄一下自己的成長軌跡。 以下是我用clusterProfiler對擬南芥的差異表達基因做的kegg富集分析: # 載入需要的R包 library(clusterProfiler) # 載入我用edgeR得到的差異表達 ...

Wed Dec 18 05:58:00 CST 2019 0 1512
RNA-seq簡單處理流程

RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先說明一下我做RNA-seq處理流程的文件樹格式: RNA-seq/ data ...

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Bulk RNA-seq 轉錄組分析

Reference : https://cloud.tencent.com/developer/article/1703051 https://blog.csdn.net/weixin_44452 ...

Fri Nov 06 22:52:00 CST 2020 0 714
 
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