Bowtie2的安裝與使用
Bowtie2的安裝與使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用來快速比對短reads(50-100bp)與參考基因組，與常規的比對軟件不同的是（如blast），Bowtie在比對比較短的reads（less ...
原文：比對程序 Bowtie2 的簡單使用
主要簡述 bowtie 的入門用法，完成從原始序列到最后完成mapping 之后的 sam格式文件。 參考文檔 最重要的參考文檔還是官方文檔： Bowtie mannual Getting started with Bowtie 文獻: Fast gapped read alignment with Bowtie 下載，安裝 下載： bowtie . . 下載已經預編譯好的軟件即可。 安裝： 先 ...
2015-09-21 21:43 0 2385 推薦指數：
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轉載自：https://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一、轉錄組還是基因組？ map常用的工具有bowtie/bowtie2, BWA,SOAP1/SOAP2等。這個問題又會被分成兩個問題，是基因組測序 ...
Hisat2 bowtie2比對結果解讀（Hisat2 Alignment summary）
RNA-seq數據的比對結果怎么解讀？網上有很多人問，這里做一個大致的總結。 Hisat2和bowtie2比對后產生的Alignment summary的格式是一樣的，如下： Alignment summary When HISAT2 finishes running, it prints ...
bowtie2 Linux安裝
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bowtie2-inspect 根據bowtie2的索引取得fasta 序列
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