熒光濾光片（Fluorescence Filters））指的是應用於熒光系統的各種濾光片，包括提取熒光能量或獲得熒光成像。它的主要特點是對干擾光的隔離度好，自發熒光干擾少。象PCR儀，熒光免疫分析儀，熒光顯微鏡等各種醫療分析和檢測儀器中都會用到熒光濾光片。通常要求熒光濾光片的截止深度在OD5（optical density，光密度，OD=－lgT）以上。
圖1.熒光濾光片
熒光濾光片一般包含三片組合，即激發濾光片、發射濾光片和二色鏡。 有的系統不帶二色鏡，這是由光路結構決定的。也有的系統用激光進行激發，不需要激發濾光片。
激發濾光片（Exciting Filter, Exciter Filter,Excitation Filter )：在熒光顯微鏡中，只有激發熒光的波長可通過的濾光片。過去使用的是短波通濾光片，現在基本上都使用帶通濾光片。其外殼上刻有箭頭，指示所推薦的光的傳播方向。
發射濾光片（Emitting Filter,Emission Filter ,Barrier Filter，Emitter)：選擇並傳輸樣本發出的熒光，其他范圍光線截止。發射光的波長比激發光的波長要長（更加靠近紅色）。可以選擇帶通濾光片或者長波通濾光片作為發射濾光片。其外殼上刻有箭頭，指示所推薦的光的傳播方向。
二色鏡（Dichroic Mirror,Dichroic Beamsplitter,Dichromatic Beamsplitter）：又稱二向色濾光片或分色鏡。與顯微鏡的光路呈45°角放置。這片濾光片反射一種顏色光（激發光）並且透射另一種顏色光（發射光），激發光的反射率大於90%，發射光的透射率大於90%。光譜中不能透過的部分被反射而不是被吸收。濾光片在透射光和反射光下的顏色互為補色，因而又稱二向色濾光片。
圖2.熒光濾光片工作示意圖
圖3.熒光濾光片曲線示意圖
對於熒光成像系統中，二色鏡和發射濾光片的透過面形有一定要求，如果忽略這個要求，有可能所成的熒光圖像是模糊的。