參考基因組fasta文件添加index
命令一
#faidx index
samtools faidx *.fa
命令二 (投遞任務時，500M內存夠用)
# bwa index
bwa index -a bwtsw *.fa
命令三
#picard index
java -jar picard.jar CreateSequenceDictionary \
R=*.fa\
O=*.dict\
這三個命令下來，建立的參考基因組的index夠大部分生信流程用