使用Cytoscape畫PPI網絡圖


打開Cytoscape軟件,根據菜單導入string_interactions.tsv文件

File ----> Import ----> Network from File

會彈出下圖對話框,在對話框中設置如下:

選中string_interactions.tsv文件,點擊打開,導入文件,結果如下圖所示。

點擊OK,彈出如下視圖,ctrl+A選中所有基因節點

使用NetworkAnalyzer分析調整網絡圖

Tools ---> NetworkAnalyzer ---> Network Analysis ---> Analyze Network

彈出如下跳選框

選擇Treat the network as undirected,點擊ok

最終生成下圖網絡

 


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