首先做出下面的基因間相互關系圖
1.准備sif文件
data.sif 網絡數據文件
gene1 pp gene2 gene3 gene4 gene5 gene6 gene7 gene8 gene9
node.txt 網絡屬性文件
gene exp
gene1 0.2
gene2 0.3
gene3 0.7
gene4 0.3
gene5 0.9
gene6 0.7
gene7 0.3
gene8 0.1
gene9 0.5
2.將兩個文件分別導入cytoscape
File --> Import -->Network--> file-->Import data.sif
File --> Import -->Table--> file-->Import node.txt
3.添加屬性
將properties--Size --修改 如下圖 將每個基因的圓圈的大小用每個基因的表達exp(cloumn 2)表示
4.保存導出即可。
選擇File --> Export -->Current Network View as graphics --> Format 選jpeg 確定--> OK