原文:使用Cytoscape畫PPI網絡圖

打開Cytoscape軟件,根據菜單導入string interactions.tsv文件 File gt Import gt Network from File 會彈出下圖對話框,在對話框中設置如下: 選中string interactions.tsv文件,點擊打開,導入文件,結果如下圖所示。 點擊OK,彈出如下視圖,ctrl A選中所有基因節點 使用NetworkAnalyzer分析調整網絡圖 ...

2019-04-03 23:10 0 2758 推薦指數:

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利用cytoscape網絡圖

首先做出下面的基因間相互關系 1.准備sif文件 data.sif 網絡數據文件 gene1 pp gene2 gene3 gene4 gene5 gene6 gene7 gene8 gene9 node.txt 網絡屬性文件 gene expgene1 0.2gene2 ...

Fri Dec 09 04:40:00 CST 2016 0 5713
python社交網絡圖

在圖書館的檢索系統中,關於圖書的信息里面有一個是圖書相關借閱關系。跟這個社交網絡圖是一樣的,反映了不同對象間的關聯性。利用python社交網絡圖使用的庫是 networkx import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt G ...

Mon Apr 10 06:41:00 CST 2017 0 4688
什么是網絡圖(Project)

一種使用節點表示工作、箭線表示工作關系的項目網絡圖。”所以這里有兩個信息:節點和箭線。 然后我 ...

Sun Jul 12 00:23:00 CST 2020 0 1150
 
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