FASTQ 文件格式轉換為 FASTA 格式

1.利用Linux命令：awk

2.用法如下：

awk '{if(NR%4 == 1){print ">" substr($0, 2)}}{if(NR%4 == 2){print}}' fastq > fasta

3.上述用法注意事項：

fastq文件必須是解壓格式的，不能是gz后綴的，雖然命令也能正常運行，但是查看文件的時候，

發現里面的內容都是亂碼的。

 

Ps：現在想想，Linux有些命令還是挺強大的。

比如：awk、tr、sed等，有空還是要學一下的