最長公共子序列


本文從三個層次分析最大公共子序列

  1. 最大公共子序列長度
  2. 最大公共子序列
  3. 算法分析

 

首先來個區別:單詞"cnblogs"

  • 子序列:從單詞中抽取字符,不能保證連續抽取。如”cn"、“cns"、”bgs"
  • 連續子序列:從單詞中連續抽取字符。如“bolog"、”cnbl"

最長公共子序列(LCS:Longest Common Subsequence)顧名思義,就是幾個詞語中最長的相同子序列。比如“cnblogs"和”belong"最大公共子序列是“blog"

        

最長公共子序列是個非常有用的算法,可以判斷兩段文字間的”雷同程度“,從而可以判別抄襲。下面先介紹幾種找出最長公共子序列長度的算法:

最大公共子序列長度

1.暴力算法

對於含有n個字符一個句子,每個位置有兩種可能(出現 or 不出現),因此總共有2*2*2....總共2^n-1個(排除空序列)序列。這樣找出來知道,在和另一個句子中的子序列意義比較(為了少算點可以只比角長度相同的)。

顯然,這種方法也太暴力了,指數增長,一點技術含量沒有。直接舍去了。

2.遞歸算法

把一個大問題看成幾個已經解決了的子問題的綜合。
        

兩個字符串,分別是stra和strb。如果對應長度是lena和lenb。那么就是求解LCS(lena, lenb)。此時先比較stra[lena-1]和strb[lenb-1](字符串是從0開始計數的)。

  • 如果相同則等於LCS(lena-1,lenb-1)+1,此時LCS(lena-1,lenb-1)不知道,接着遞歸
  • 如果不同則比較LCS(lena-2,lenb-1)和LCS(lena-1,lenb-2),前者大,就等於前者;后者大,后者。中間步驟不知道,接着遞歸
  • 如果遞歸到了LCS()中的一個數為-1了那就相當於存在空串了,公共的長度肯定是0了。

參考程序:

#include <stdio.h>
#include <string.h>
int LCS(int m, int n);
char a[100];
char b[100];

int main()
{
    strcpy(a, "cnblogs");
    strcpy(b, "belong");
    int lena = strlen(a);
    int lenb = strlen(b);
    printf("LCS:%d\n", LCS(lena-1, lenb-1));
    return 0;
}

int LCS(int m, int n)
{
    if(m==-1 || n==-1)
        return 0;
    else if(a[m] == b[n])
        return 1 + LCS(m-1, n-1);
    else
        return LCS(m-1, n) > LCS(m, n-1) ? LCS(m-1, n):LCS(m, n-1);
}

3.動態規划

和遞歸算法的大化小問題思路不同,動態規划是把一個問題轉化成一些列的單階段問題。

在利用動態規划找出最長公共子序列時,目標是求LCR(lena,lenb),我們把任意兩點的LCR求出來,此時要用二位數組表示。

基本原理公式還是那樣:

此時注意,字符串計數是從0開始的,現在用二維數組表示,就不能像上面一樣出現-1了,現在用二維數組表示個數時,從1開始,即LCR[m][n],表示stra[m-1]和strb[n-1]之間的最大子序列長度。

現在用具體的例子闡明動態規划的過程:

stra = "cnblogs"

strb = "belong"

  • LCR[m][0]=0(表示:str[m-1] 和”空“間的關系);同理LCR[0][n]=0
  • LCR[1][1]:先看stra[0]和strb[0]間想不相同('c'和‘b'不相同),就比較LCR[1][0] 和LCR[1][0]都為0,那么LCR[1][1]為0;
  • 一直這樣做下去......

         

參考程序:

#include <stdio.h>
#include <string.h>
char stra[100], strb[100];
int lena, lenb; 
int matrix[100][100];
void LCS();
int main()
{
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    memset(matrix, 0, sizeof(matrix));
    LCS();
    return 0;
}

void  LCS()
{
    int i=0, j=0;
    for(i=0; i<lena; i++)
    {
        for(j=0; j<lenb; j++)
        {
            if(stra[i] == strb[j])
            {
                matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j] + 1;
            }
            else
            {
                if(matrix[i+1][j] >= matrix[i][j+1])
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i+1][j];
                }
                else
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j+1];
                }
            }
        }
    }

    printf("LCS:%d\n", matrix[lena][lenb]);
}

最大公共子序列

有了最長公共子序列長度核心公式,求個長度還是很容易的,現在要求出具體的最大公共子序列。暴力算法是理論上是可以求出來的,但是過於繁瑣與低效,棄了。動態規划與遞歸思路是一樣的。

動態規划

這樣標記:

  • 當stra[i] == strb[j]時,標斜向上的箭頭(記值為0)
  • 當LCR[i+1][j]≥LCR[i][j+1]時,標向左箭頭(記值為1)
  • 當LCR[i+1][j]<LCR[i][j+1]時,標向上箭頭(記值為-1)

尋找子序列:

  • 見0記下, i--, j--
  • 見1左拐,j--
  • 見-1上拐,i--

圖示說明:

      

參考算法:

#include <stdio.h>
#include <string.h>
char stra[100], strb[100];
int lena, lenb; 
int matrix[100][100];
int tag[100][100];
void LCS();
void getLCS();
int main()
{
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    memset(matrix, 0, sizeof(matrix));
    LCS();
    getLCS();
    return 0;
}

void  LCS()
{
    int i=0, j=0;
    for(i=0; i<lena; i++)
    {
        for(j=0; j<lenb; j++)
        {
            if(stra[i] == strb[j])
            {
                matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j] + 1;
                tag[i+1][j+1] = 0;
            }
            else
            {
                if(matrix[i+1][j] >= matrix[i][j+1])
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i+1][j];
                    tag[i+1][j+1] = 1;
                }
                else
                {
                    matrix[i+1][j+1] = matrix[i][j+1];
                    tag[i+1][j+1] = -1;
                }
            }
        }
    }
    //輸出次數矩陣
    for (i=1; i<=lena; i++)
    {
        for (j=1; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", matrix[i][j]);
        printf("\n");
    }
    printf("****************\n");
    //輸出方向轉移矩陣
    for (i=1; i<=lena; i++)
    {
        for (j=1; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", tag[i][j]);
        printf("\n");
    }
    printf("LCS:%d\n", matrix[lena][lenb]);
}

void getLCS()
{
    int i = lena, j = lenb, sum=0;
    char seq[100];
    while(i != 0 && j != 0)
    {
        if(tag[i][j] == 0)
        {
            seq[sum] = stra[i-1];
            i--;
            j--;
            sum++;
        }
        else if(tag[i][j] == 1)
            j--;
        else
            i--;
    }
    for(i=sum-1; i>=0; i--)
        printf("%c ", seq[i]);
}

遞歸算法

遞歸算法輸出矩陣的思路與動態規划思路完全一致,就是在遞歸過程中標記,再回溯即可。

參考代碼:

#include <stdio.h>
#include <string.h>
int LCS(int m, int n);
void getLCS();
char stra[100], strb[100];
int lena, lenb;
int tag[100][100];
char seq[100];
int main()
{
    int i, j;
    memset(tag, 0, sizeof(tag));
    strcpy(stra, "cnblogs");
    strcpy(strb, "belong");
    lena = strlen(stra);
    lenb = strlen(strb);
    printf("LCS:%d\n", LCS(lena-1, lenb-1));
    getLCS();
    for(i=0; i<=lena; i++)
    {
        for(j=0; j<=lenb; j++)
            printf("%d ", tag[i][j]);
        printf("\n");
    }

    return 0;
}

int LCS(int m, int n)
{
    if(m==-1 || n==-1)
    {
        return 0;
    }
    else if(stra[m] == strb[n])
    {
        tag[m+1][n+1] = 1;
        return 1 + LCS(m-1, n-1);
    }
    else
    {
        if(LCS(m, n-1) > LCS(m-1, n))
        {
            tag[m+1][n+1] = 2;
            return LCS(m, n-1);
        }
        else
        {
            tag[m+1][n+1] = 3;
            return LCS(m-1, n);
        }
    }
}

void getLCS()
{
    int i = lena, j = lenb, sum=0;
    while(i != 0 && j != 0)
    {
        if(tag[i][j] == 1)
        {
            seq[sum] = stra[i-1];
            i--;
            j--;
            sum++;
        }
        else if(tag[i][j] == 2)
            j--;
        else
            i--;
    }
    printf("The lCS is:");
    for(i=sum-1; i>=0; i--)
        printf("%c ", seq[i]);
    printf("\n");
}

算法分析

m表示第一個字串長度,n表示第二個字串長度。

動態規划

時間復雜度:

  • 建立矩陣需要,需要花費時間o(mn)
  • 回溯需要至多花費時間o(m+n)

綜上,兩者相加,時間復雜度為o(mn)

空間復雜度:

  • 構建矩陣需要空間o(mn)
  • 構建標記矩陣需要空間o(mn)

綜上,二者相加,空間復雜度為o(mn)

 

 

 

 


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