barcode),借此可以分辨出哪些是参照物序列,哪些是待检品序列。 An RNA spike-in ...
ERCC的调研 在RNA seq数据分析中,为了比较不同样本 不同基因之间的表达差异,通常会对数据进行标准化转化,得到RPKM FPKM TPM等指标。但是这些指标都是相对定量,相对定量有两个前提: 是绝大多数的gene表达量不变 是高表达量的gene表达量不发生改变。 可是在一些比较特殊的样本体系下,这两个基本假设有可能不能同时符合。比如针对很多癌症样本,经常会出现一些很重要的高表达gene发生 ...
2020-02-25 17:45 0 2900 推荐指数:
barcode),借此可以分辨出哪些是参照物序列,哪些是待检品序列。 An RNA spike-in ...
单细胞转录组确实是利器,但我们大多只利用了表达的信息,而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章,讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...
基本问题: RNA的起源、定位和意义 明确RNA的各种概念分类 各种RNA的基本结构和功能 意义 有一种学说:RNA是生命的起源。 先有鸡(DNA)还是先有蛋(蛋白质),好像都不太可能,那有没有可能先有RNA?桥接了DNA和蛋白质,RNA本身也是一种酶 ...
一个比原版更好用的RNA velocity分析工具:velocyto GitHub:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc:http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 历史 ...
单细胞测序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...
郑重声明:原文参见标题,如有侵权,请联系作者,将会撤销发布! 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NeurI ...
概述 尖峰测试(Spike testing)在性能测试中属于压力测试的一个子集。指的是在某一瞬间或者多个频次下用户数和压力陡然增加的场景。 为了验证我们的网站在访问用户急剧增加的情况下,或者短时间内反复急剧增加工作负载时能否正常工作;以及程序能否从高负荷中恢复并正常工作时常常用到这种测试 ...