原文:动物基因组与植物基因组基本差异

植物vs动物总结版: 简述高等植物基因组 可以以拟南芥和水稻基因组为例 与高等动物基因组 可以以人类 果蝇等基因组为例 在基因结构层面展示出来的基本差异。 高等植物基因组与高等动物基因组在基因结构上的基本差异主要是生命组学的第一困境,即复制 转录负载困境。 机制: .从平衡流看, . 高等植物基因组以复制负载为主,由单细胞祖先就决定,即高等植物的重复序列位于基因间区,只复制不转录,这种情况的重复序 ...

2019-12-19 16:01 0 1047 推荐指数:

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参考基因组

参考基因组版本命名参考基因组联盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等机构组成。GRC 利用最佳的技术装配,纠正,增加基因组序列,以此作为在生信分析领域作为参考的基因组。人基因组官名叫 GRCh38 (Genome ...

Sat Jun 12 20:52:00 CST 2021 0 1267
基因组注释

基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复序列(Tendam repeat)和散在重复序列 ...

Mon Jan 11 19:48:00 CST 2016 0 4001
构建一个近乎完整的植物基因组

目录 前言 1. 单分子长度长测序 2. 长度长基因组组装的错误倾向 3. 物理图谱技术 4. 解决复杂植物基因组 5. 利用组装图 挑战和展望 前言 植物基因组大小跨越几个数量级,倍性和杂合性变化,以及新旧基因组转座子变化等带来组装挑战 ...

Wed Feb 03 04:08:00 CST 2021 0 330
如何到NCBI提交基因组

1 步骤和说明 NCBI官方说明 点此处打开提交基因组页面 以下例子:纯菌的基因组草图用于新菌鉴定。 1.1 提交基因组数据到 NCBI 需要什么? .fsa 格式的基因组数据; fsa 就是用公司返回的 .sqn 的数据改为 .fsa 后缀,里面是 fasta格式 ...

Thu Mar 29 22:38:00 CST 2018 0 6181
NextDenovo 组装基因组

NextDenovo 是有武汉未来组团队开发出来用于组装ONT,Pacbio, HIFI (默认参数可对60-100X数据更有效),可通过correct--assemble对其进行组装。组装后, ...

Fri Jan 22 22:52:00 CST 2021 0 456
基因组转座元件

转座元件是一类能改变其自身在基因组当中的位置的DNA重复序列,它能够使得突变产生,也能“逆转”已有突变,它能改变生物细胞的遗传属性和基因组稳定性。1951年,美国冷泉港著名女性细胞遗传学家Barbara McClintock发表文章“Induction of Instability ...

Wed Jun 17 19:08:00 CST 2020 0 540
综述:如何研究植物基因组DNA羟甲基化(5hmC)?|易基因

大家好,这里是专注表观学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 概述: 基因表达模式的变化可能是由于在DNA序列不变的情况下基因组发生的修饰而引起的; 这些修饰包括胞嘧啶甲基化生成5-甲基胞嘧啶(5mC),从而产生可遗传的表观突变和新的表观等位基因。这种类型的非序列变异称为表观遗传学 ...

Tue Apr 12 22:28:00 CST 2022 0 617
 
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