pca ， nmds , pcoa 图添加分组的椭圆
对于pca , nmds, pcoa 这些排序分析来说，我们可以从图中看出样本的排列规则，比如分成了几组。 为例样本分组更加的直观，我们可以根据实验设计时的样本分组情况，对属于同一个group的样本添加1个椭圆或者其他多边形。 新版本的ggplot2 中提供了stat_ellipse ...
原文：PCA和PCoA
讲解很详细：http: blog.genesino.com PCA PCA分析一般流程： 中心化 centering， 均值中心化，或者中位数中心化 ，定标 scale，如果数据没有定标，则原始数据中方差大的变量对主成分的贡献会很大。 根据前面的描述，原始变量的协方差矩阵表示原始变量自身的方差 协方差矩阵的主对角线位置 和原始变量之间的相关程度 非主对角线位置 。如果从这些数据中筛选主成分，则要 ...
2018-10-28 14:40 0 4099 推荐指数：
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