原文:什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA Seq RNA Sequencing ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 Next Generation Sequencing, NGS 。 基于杂交的办法,主要是依靠印刷有荧光标记探针的基因芯片来实现。比如说基因组芯片,它高密 ...

2018-10-18 21:42 0 2871 推荐指数:

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简单理解RNA-seq

简单理解RNA-seq 刘小泽 已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天就当一个小故事看吧,看了statQuest,感觉讲的很棒,于是分享给大家原版视频后台回复 ...

Sat Oct 20 04:27:00 CST 2018 1 1989
RNA-seq(9):功能富集分析

这部分开始进行基本的富集分析,两类 A:差异基因富集分析(不需要表达值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有无差异, ...

Sat Dec 15 19:18:00 CST 2018 0 1543
转录组测序(RNA-seq)技术

转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水 平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应 用于基础研究、临床 ...

Sun May 12 00:18:00 CST 2019 0 1336
RNA-seq建库技术 | RNA sequence library construction

为什么必须了解建库技术? 转录组有哪些分类? 有哪些常见的RNA-seq建库技术?各有什么特点 活体真核细胞里有哪些RNA,各自有什么功能,占比多少? PCR对RNA-seq的影响?PCR free是什么意思? 为什么RNA-seq总有一部分reads无法比对到转录组? RNA-seq ...

Sun Jul 05 02:38:00 CST 2020 0 1728
RNA-seq 数据的简单分析

主要介绍如何分析RNA-seq 数据 参考文档 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...

Fri Oct 09 04:56:00 CST 2015 0 11048
RNA-Seq分析——KEGG富集分析

入学到现在已经有小半年了,最近正好在做RNA-Seq的分析,记录一下自己的成长轨迹。 以下是我用clusterProfiler对拟南芥的差异表达基因做的kegg富集分析: # 载入需要的R包 library(clusterProfiler) # 载入我用edgeR得到的差异表达 ...

Wed Dec 18 05:58:00 CST 2019 0 1512
RNA-seq简单处理流程

RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先说明一下我做RNA-seq处理流程的文件树格式: RNA-seq/ data ...

Sun Mar 11 02:27:00 CST 2018 0 2961
Bulk RNA-seq 转录组分析

Reference : https://cloud.tencent.com/developer/article/1703051 https://blog.csdn.net/weixin_44452 ...

Fri Nov 06 22:52:00 CST 2020 0 714
 
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