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MAD(Median absolute deviation, 中位數絕對偏差)

定義 MAD(Median absolute deviation, 中位數絕對偏差)是單變量數據集中樣本差異性的穩健度量。mad是一個健壯的統計量,對於數據集中異常值的處理比標准差更具有彈性,可以大 ...

Sun Mar 11 04:04:00 CST 2018 0 1740
somatic和germline突變有什么區別

Somatic突變是不遺傳的,在研究方法上主要偏重采集癌症組織和正常組織進行比較得到結果(在Call Somatic mutations 的時候最好有同一個體的正常組織進行參照)從研 ...

Mon Jun 26 22:13:00 CST 2017 0 2063
最新HGVS基因突變命名規則速覽

導讀:隨着二代測序技術臨床應用的不斷增加,越來越多與癌症發生發展密切相關的突變被鑒定出來。將基因突變的結果更好地轉化為實際臨床應用,統一而通用的突變命名規則就顯得尤為重要。人類基因組變異協會(HGVS ...

Fri Mar 09 02:41:00 CST 2018 0 1533
VCF格式說明

VCF是用於描述SNP,INDEL和SV結果的文件,下面所記錄的是以GATK軟件結果的VCF文件,與SAMtools的結果有點不同 VCF文件可以分為兩部分看,最上面#號注釋的的部分是對一些參數的解 ...

Tue Jan 07 18:33:00 CST 2020 0 797

 
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