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K-mer分析

0. 基本參數   基因組大小:G   Read讀長:L   總Read條數:n_r 1. 鹼基深度分布     單條Read測序覆蓋到某一個鹼基的概率:L/G   因為L/G很小,n_r ...

Sat Nov 03 09:52:00 CST 2018 0 2392
全基因組數據分析原始數據到變異數據(Fastq->VCF)

WGS數據分析目的:檢測出每個樣本基因組中的變異集合(不同樣本中的差異序列)WGS數據分析流程分為三步:原始數據質控 -> 數據預處理 -> 變異檢測1.原始數據質控階段:拿到原始測序數據 ...

Sat May 30 06:20:00 CST 2020 0 771
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Sat Nov 03 06:05:00 CST 2018 0 906
變異位點有害性軟件評估

主要有5款軟件,MutationTaster>Provean>PolyPhen2 >MutationAssessor>SIFT MutationTaster:通過檢測 ...

Tue Mar 24 00:37:00 CST 2020 0 778

 
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