NGS檢測SNP
1，Fastq數據質控 2,Fastq轉化成bam，包含頭文件 3,sam 轉化成bam，如果SAM文件中有header @SQ lines。 4,sort b ...
原文：【變異檢測】SNP INDEL檢測
重測序SNP和INDEL變異檢測主要有 套方案，samtools bcftools GATK assembly versus assembly .samtools bcftools方法 samtools和bcftools是我們做生信最常用的軟件之一，功能非常的強大。這套軟件組合可以單call，也可以群call來檢測樣本變異。單call提供一個樣本，群call就提供多個樣本。samtools bcf ...
2022-04-08 17:23 0 2454 推薦指數：
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