【基因組注釋】同源注釋比對軟件tblastn、gamp和exonerate比較
基因結構預測中同源注釋策略，將mRNA、cDNA、蛋白、EST等序列比對到組裝的基因組中，在文章中通常使用以下比對軟件： tblastn gamp exonerate blat 根據我的實測，以上軟件整體都比較慢。gmap可設置多線程來提升速度。tblastn ...
原文：GAMP學習日志1—GAMP調試
一 VS配置及GAMP下載 VS配置：VS 專業版 下載地址：https: www.ngs.noaa.gov gps toolbox GAMP GAMP.zip 注意安裝的GAMP路徑，調試過程的文件路徑需要根據安裝路徑進行修改 二 GAMP調試 . 建立GAMP項目 下載解壓后的GAMP文件夾： 在VS中建立空項目 或者控制台應用，需手動刪除自帶的main函數文件 盡量不要建立在中文路徑下，可能 ...
2021-10-04 14:06 0 163 推薦指數：
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