原文:R語言 繪制熱圖 pheatmap

pheatmap實際上是 Pretty Heatmaps 的縮寫,簡單地來說,一個可以傻瓜式繪制聚類熱圖的R包。常用參數介紹基礎設置main 圖的名字file 要保存圖的名字color 表示顏色,賦值漸變顏色調色板colorRampPalette屬性,選擇 綠,黑,紅 漸變,分為 個等級,,例:color colorRampPalette c navy , white , firebrick sc ...

2021-06-14 17:10 0 1694 推薦指數:

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Rpheatmap:用參數一步步詳細繪制熱

經常會想到用熱來展示某個基因或某些基因的表達量問題,今天用Rpheatmap包一步步繪制熱。 第一步:公眾路徑設置,調用包pheatmap,讀取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入繪制熱1-15) 一建熱1) p<-pheatmap(data ...

Sun Jun 07 05:04:00 CST 2020 0 4793
R語言——pheatmap

載入包 載入數據 繪制熱 生成行列注釋 ...

Sun Mar 07 05:23:00 CST 2021 0 305
GraphPadPrism繪制熱

http://www.sohu.com/a/319918959_278730 http://www.dxy.cn/bbs/thread/34987035?sf=2&dn=4#34987 ...

Wed Nov 27 04:35:00 CST 2019 0 765
Python 繪制熱

1.matplitlib繪制熱 2.Seaborn繪制熱 ...

Wed Sep 04 00:50:00 CST 2019 0 2712
ggplot 繪制熱

生成測試數據 繪圖首先需要數據。通過生成一堆的向量,轉換為矩陣,得到想要的數據。 ...

Wed Jan 24 05:14:00 CST 2018 0 1205
R語言繪制QQ

無論是直方圖還是經驗分布,要從比較上鑒別樣本是否處近似於某種類型的分布是困難的 QQ可以幫我們鑒別樣本的分布是否近似於某種類型的分布 R語言,代碼如下: > qqnorm(w);qqline(w)> w <- c(75.0, 64.0 ...

Tue Oct 30 18:14:00 CST 2018 0 6702
pheatmap繪制“熱”,你需要的都在這

可以聚合大量的數據,並可以用一種漸進色來優雅地表現,可以很直觀地展現數據的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語言 pheatmap 包從頭開始繪制各種漂亮的熱。參數像積木,拼湊出你最喜歡的熱即可,如下圖: 基因和樣本都可以單獨聚類,排序,聚類再分組,行列注釋,配色 ...

Tue Jul 30 21:52:00 CST 2019 0 10680
 
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