GraphPadPrism繪制熱圖


http://www.sohu.com/a/319918959_278730

 

http://www.dxy.cn/bbs/thread/34987035?sf=2&dn=4#34987035

 

https://www.sohu.com/a/201713697_301099

 

https://zhuanlan.zhihu.com/p/21258579

 

TBtools、heml、PermutMatrixEN、SPSS、origin

PermutMatrixEN進行雙向聚類,而且可以圖形最優化排列,很方便看出熱點關系,SPSS不能進行最優可視化

 

heml:

https://www.plob.org/article/8465.html/comment-page-1/#comments

TBTOOLS:

https://www.omicshare.com/forum/thread-1062-1-1.html

http://www.sohu.com/a/328823607_278730

 

PermutMatrixEN:

 

EuPathDomains: The Divergent Domain DataBase for Eukaryotic Pathogens

 

http://www.atgc-montpellier.fr/EuPathDomains/

origin

http://www.360doc.com/content/18/0504/20/42030643_751167302.shtml

數據的歸一化

 

 

Origin 對數據Standardize的方式采用z-score標准化,即將數據與平均數(本文為每行數據的平均數)相減再除以標准差(本文為每行數據的平標准差)的過程。用公式表示為:z=(x-μ)/σ。這樣做的目的是將大於平均數的數“轉化”為較小的正數,小於平均數的數“轉化”為較小的負數。當然這不需要我們手動去計算。

 


免責聲明!

本站轉載的文章為個人學習借鑒使用,本站對版權不負任何法律責任。如果侵犯了您的隱私權益,請聯系本站郵箱yoyou2525@163.com刪除。



 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM