GraphPadPrism绘制热图


http://www.sohu.com/a/319918959_278730

 

http://www.dxy.cn/bbs/thread/34987035?sf=2&dn=4#34987035

 

https://www.sohu.com/a/201713697_301099

 

https://zhuanlan.zhihu.com/p/21258579

 

TBtools、heml、PermutMatrixEN、SPSS、origin

PermutMatrixEN进行双向聚类,而且可以图形最优化排列,很方便看出热点关系,SPSS不能进行最优可视化

 

heml:

https://www.plob.org/article/8465.html/comment-page-1/#comments

TBTOOLS:

https://www.omicshare.com/forum/thread-1062-1-1.html

http://www.sohu.com/a/328823607_278730

 

PermutMatrixEN:

 

EuPathDomains: The Divergent Domain DataBase for Eukaryotic Pathogens

 

http://www.atgc-montpellier.fr/EuPathDomains/

origin

http://www.360doc.com/content/18/0504/20/42030643_751167302.shtml

数据的归一化

 

 

Origin 对数据Standardize的方式采用z-score标准化,即将数据与平均数(本文为每行数据的平均数)相减再除以标准差(本文为每行数据的平标准差)的过程。用公式表示为:z=(x-μ)/σ。这样做的目的是将大于平均数的数“转化”为较小的正数,小于平均数的数“转化”为较小的负数。当然这不需要我们手动去计算。

 


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