原文:構建一個近乎完整的植物基因組

目錄 前言 . 單分子長度長測序 . 長度長基因組組裝的錯誤傾向 . 物理圖譜技術 . 解決復雜植物基因組 . 利用組裝圖 挑戰和展望 前言 植物基因組大小跨越幾個數量級,倍性和雜合性變化,以及新舊基因組轉座子變化等帶來組裝挑戰。三代和物理圖譜提供了新機會,單倍型定相 結構變異分析 從頭泛基因組研究成為新興組裝熱點。 植物基因組發展: 擬南芥:sanger BAC by BAC。 shotgun ...

2021-02-02 20:08 0 330 推薦指數:

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動物基因組植物基因組基本差異

植物vs動物總結版: 簡述高等植物基因組(可以以擬南芥和水稻基因組為例)與高等動物基因組(可以以人類、果蠅等基因組為例)在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組基因結構上的基本差異主要是生命學的第一困境,即復制-轉錄負載困境。 機制: 1.從平衡流 ...

Fri Dec 20 00:01:00 CST 2019 0 1047
綜述:如何研究植物基因組DNA羥甲基化(5hmC)?|易基因

大家好,這里是專注表觀學十余年,領跑多組學科研服務的易基因。 概述: 基因表達模式的變化可能是由於在DNA序列不變的情況下基因組發生的修飾而引起的; 這些修飾包括胞嘧啶甲基化生成5-甲基胞嘧啶(5mC),從而產生可遺傳的表觀突變和新的表觀等位基因。這種類型的非序列變異稱為表觀遺傳學 ...

Tue Apr 12 22:28:00 CST 2022 0 617
參考基因組

參考基因組版本命名參考基因組聯盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配,糾正,增加基因組序列,以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 (Genome ...

Sat Jun 12 20:52:00 CST 2021 0 1267
基因組注釋

基因組注釋主要包括四個研究方向:重復序列的識別;非編碼RNA的預測;基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義:重復序列可分為串聯重復序列(Tendam repeat)和散在重復序列 ...

Mon Jan 11 19:48:00 CST 2016 0 4001
 
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