post-GWAS：使用coloc進行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到顯著信號位點后，需要解釋顯著信號位點如何影響表型。 常見的一個解釋方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL共定位； 3）GWAS和meQTL共定位； 4）GWAS和pQTL共定位； 其中，GWAS ...
原文：Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
eQTL mQTL共定位分析的作用 eQTL mQTL共定位分析屬於Post GWAS的一項重要工作，旨在GWAS結果的基礎上鑒定與表型相關的eQTL和mQTL位點。 傳統的GWAS是將全基因組范圍內的常見變異進行關聯分析，鑒定與表型相關的基因座，但鑒定出來的位點大多數位於基因間隔區，其如何通過基因或者通路影響表型很難被闡述。 基於此，開發了eQTL mQTL共定位分析方法。 其原理是利用已有數 ...
2020-12-18 20:33 0 1079 推薦指數：
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