從零開始學生信-meme的安裝和使用
軟件：meme-suit 用途：鑒定motif 目的：其實我這里主要是為了使用streme模塊（因為sequence number超過50）。 辦法： 1. 如果只安裝meme，可以直接用conda install -c bioconda meme。 2. 如果需要所有的套件，需要手動 ...
原文：從零開始學生信-orthofinder的安裝和使用-基因家族分析
環境變量 注釋掉conda ，source .bashrc 因為orthofinder是由python 編寫的。 conda install orthofinder 若在上一章之后沒有重啟的同學請重啟后操作。 由於是剛開始搭建，這里沒有給orthofinder單獨一個環境空間，這一套下來，基本的基因分析軟件都安裝好了。 包括兩兩比對軟件：blast，diamond。 diamond快，且宣稱其方 ...
2020-12-11 20:38 0 1649 推薦指數：
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基因家族分析之同源基因的尋找
Blast進行同源基因的尋找 參考博客： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/673/ 基於蛋白的比對結果，尋找某一個蛋白家族的同源基因，使用如下的參數 ...
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1. 數據庫的配置 OrthoMCL的分析需要先行建立mysql賬戶並建立相應的數據庫。關於mysql ...
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