原文:Bulk RNA-seq 轉錄組分析

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2020-11-06 14:52 0 714 推薦指數:

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Bulk RNA-Seq轉錄組學習

與之對應的是single cell RNA-Seq,后面也會有類似文章。 參考:https://github.com/xuzhougeng/Learn-Bioinformatics/ 作業:RNA-seq基礎入門傳送門 資料:RNA-seq Data Analysis-A Practical ...

Thu Aug 03 00:39:00 CST 2017 0 3218
轉錄組測序(RNA-seq)技術

對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,在分析轉錄本的結構和表達水平的同 時,還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本 ...

Sun May 12 00:18:00 CST 2019 0 1336
RNA-seq(9):功能富集分析

這部分開始進行基本的富集分析,兩類 A:差異基因富集分析(不需要表達值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有無差異,需要全部genes表達值 ...

Sat Dec 15 19:18:00 CST 2018 0 1543
RNA-Seq分析——KEGG富集分析

入學到現在已經有小半年了,最近正好在做RNA-Seq分析,記錄一下自己的成長軌跡。 以下是我用clusterProfiler對擬南芥的差異表達基因做的kegg富集分析: # 載入需要的R包 library(clusterProfiler) # 載入我用edgeR得到的差異表達 ...

Wed Dec 18 05:58:00 CST 2019 0 1512
RNA-seq 數據的簡單分析

主要介紹如何分析RNA-seq 數據 參考文檔 Wikipedia-RNA-seq paper: RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics TopHat Cufflinks CummeRbund TopHat ...

Fri Oct 09 04:56:00 CST 2015 0 11048
RNA-Seq分析軟件HTSeq的安裝

1.本人剛開始安裝的時候,先下載相關的軟件包,然后安裝installtion中的方法安裝, 運行的時候老是報錯。根據錯誤提示安裝解決方法。也參考了其他的筆友的一些建議, 發現特別麻煩,后來無意中 ...

Sun Sep 10 03:24:00 CST 2017 0 1324
RNA-seq 基本分析流程

。而且 RNA-seq 還可以觸及以前無法研究的領域,比如復雜結構的轉錄體。 RNA-seq可以應用 ...

Wed Feb 27 02:20:00 CST 2013 2 14247
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
 
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