RNA-Seq分析軟件HTSeq的安裝


1.本人剛開始安裝的時候,先下載相關的軟件包,然后安裝installtion中的方法安裝,

 運行的時候老是報錯。根據錯誤提示安裝解決方法。也參考了其他的筆友的一些建議,

發現特別麻煩,后來無意中發現有小伙伴用bioconda來安裝,一個命令,簡單快捷。

2.bioconda安裝HTSeq操作如下:

下載安裝miniconda(即bioconda)。

添加channels

等等

(具體步驟參考本人的相關bioconda的博客)

安裝HTSeq的命令如下:

conda   install  HTSeq

輸入上述命令,根據提示操作,可能有點慢。

安裝完成后,測試一下HTSeq安裝是否成功。

$ python(HTSeq在Python中運行)

>>> import HTSeq

上述操作Import HTSeq如果沒有返回任何信息,

說明安裝成功。

PS:bioconda真心好用啊,但是好像不是所有的安裝都是

conda install softname,好像有的軟件需要其他的參數

記着就好啦,反正暫時沒有遇到。


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