原文:Circos軟件學習

circos 是一款perl 語言開發的畫圖軟件,提供了染色體相關數據的一種可視化方式。其制作的圖表精美,被科研工作者廣泛使用。Circos可以對染色體相關數據進行可視化,以每條染色體為一個扇區,組成一個圓形,如圖 所示。也可以對其他表格形式的數據進行可視化,以每個樣本作為扇區,以其上的特征作為圖形層次。如圖 所示,可以以物種作為扇區,展示物種間的關系。Circos圖最初以Perl語言開發,后來 ...

2020-05-10 11:36 0 724 推薦指數:

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Circos

Circos官網 http://circos.ca 在線繪圖工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/ Circos圖的誕生 Circos圖誕生於2009年,當時是作為一個繪圖工具類的文章發表在Genome Research(最新 ...

Mon Sep 16 17:58:00 CST 2019 0 503
Circos入門教程

1 Circos簡介 Circos是一個非常酷炫的基因組數據可視化軟件,能夠將基因組數據映射到環形的基因組坐標上,用相互嵌套的環道來展示基因組數據,還可以通過連接線來呈現基因組區塊之間的關系。Circos的開發者是一位加拿大的生物信息學家Martin Krzywinski,值得一提的是 ...

Fri Nov 12 19:00:00 CST 2021 0 13012
Circos繪圖—基礎

之前看過一張關於人口遷徙的圖,感覺很驚艷,后面了解到Circos這個工具,雖然主要是用於染色體基因組的圖的繪制,但是在其他方面也是有着很好的可視化效果 汽車交易中的用戶行為模式追蹤 How do customers "flow" between brands and car segments ...

Sat Feb 15 07:29:00 CST 2020 0 4343
從基因組可視化工具——circos說起,circos安裝

這是博客改版的第一篇博文,選擇最近使用的生物信息學軟件——circos開始寫起。circos是用perl寫的生物軟件,從發表的文章來看 學習circos主要是熟悉配置文件的編輯方法,搞清楚其中的標簽、參數的含義。只有完全清楚了這些東西才能夠輕松自如的讓circos ...

Thu Jul 28 19:02:00 CST 2016 0 2308
STAR軟件學習

下載地址與參考文檔 https://github.com/alexdobin/STAR/archive/2.5.3a.tar.gz wget https://github.com/alexd ...

Fri May 24 21:53:00 CST 2019 0 676
Microstation軟件操作學習1

1.使軟件支持中文等語言:C:\Program Files\Bentley\MicroStation CONNECT Edition\MicroStation\config\system\mslocale.cfg 用管理員身份打開記事本,修改: 2.新建文件時的種子文件位置:C ...

Wed Apr 08 22:04:00 CST 2020 0 709
為什么學習軟件工程

進,合成一個方法。不懂得舉一反三。學習軟件工程這門課程,解開了我的很對困惑。 軟件工程學讓我 ...

Tue Mar 03 05:31:00 CST 2020 0 974
 
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