蛋白質序列位置特異性矩陣(PSSM)的獲取的准備工作：fasta序列的處理
由於獲取位置特異性矩陣需要使用psiblast -db swissprot -query 0.txt -evalue 0.001 -num_iterations 3 -out_ascii_pssm 0.pssm命令獲取，然而該命令只對一個序列比對，如果把大量蛋白質序列輸入，其結果會不斷更新，最后 ...
原文：蛋白質序列位置特異性矩陣(PSSM)的獲取
一 下載安裝ncbi blast 一定要是最新版本，在這里吃了苦頭 下載地址：https: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast executables blast LATEST 安裝blast：按照提示安裝即可 這里我們要用到主要的文件為：rpsblast.exe 二 下載對比數據庫 下載地址：ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast db 這里可以選擇nr ...
2020-04-25 21:47 0 3434 推薦指數：
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