原文:genefuse使用DNA數據檢測融合基因神器

genefuse 手頭有一批DNA數據,打算進行基因融合分析 Google搜羅一番,發現都是基於轉錄組RNA數據的 好不容易找到一款基於DNA數據,genefuse 在GitHub,anaconda都有源代碼包 軟件原網址: https: github.com OpenGene genefuse genefuse直接基於fastq文件分析,所以你只要准備好fastq.gz文件就可以 安裝 con ...

2020-04-18 11:30 1 781 推薦指數:

查看詳情

FusionMap 檢測融合基因

定義:融合基因是指兩個或者多個基因聯合起來,一起轉錄形成一個轉錄本; 檢測的意義:融合基因可以作為某些疾病的特異分子標記,比如   bcr/abl融合基因存在於95%以上的慢性粒細胞白血病患者中;   AML1/ETO融合基因主要見於急性粒細胞白血病部分分化型患者中;   CBF ...

Thu Mar 09 22:30:00 CST 2017 0 1250
BCR-ABL融合基因檢測

費城染色體 費城染色體(Philadelphia chromosome, Ph (or Ph') chromosome),或稱費城染色體易位(Philadelphia translocation), ...

Wed Aug 21 03:44:00 CST 2019 0 3461
FusionCancer-人類癌症相關的融合基因數據

RNA-seq 測序可以用於融合基因的發現,在過去的十幾年里,RNA-seq 測序數據不斷增加,發現的融合基因數據也不斷增加; FusionCancer 是一個人類癌症相關的融合基因數據庫,利用NCBI SRA數據庫中的RNA-seq 數據,采用tophat-fusion ...

Tue Sep 26 23:01:00 CST 2017 2 2635
《全基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
通過FISH和下一代測序檢測肺腺癌ALK基因融合比較

ALK FISH探針是FDA批准的用於檢測肺癌患者中ALK重排的方法,這些患者可能受益於ALK激酶抑制劑。FISH測定在技術上可能具有挑戰性並且難以解釋。已經有研究者提出以ALK免疫組織化學和下一代測序作為替代方法。在本研究中,我們比較了各種ALK-FISH模式與下一代測序(NGS)針對基因融合 ...

Wed Mar 08 16:57:00 CST 2017 0 1532
細胞,染色體,DNA基因的關系

資料來源: 細胞、染色體、DNA基因的關系 細胞核中包含染色體,人體共有23對染色體(22+XY/XX),染色體由DNA組成,DNA是由互補鹼基對組成的雙螺旋結構,DNA鏈中只有一部分信息可以編碼為蛋白質,這些蛋白質是構成細胞和組織最小的組成成分,這些有效編碼的部分稱為gene,而不能有效編碼 ...

Wed Jun 24 23:40:00 CST 2020 0 2646
《全基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記WGS

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Fri Jul 02 02:01:00 CST 2021 0 204
綜述:如何研究植物基因DNA羥甲基化(5hmC)?|易基因

大家好,這里是專注表觀組學十余年,領跑多組學科研服務的易基因。 概述: 基因表達模式的變化可能是由於在DNA序列不變的情況下基因組發生的修飾而引起的; 這些修飾包括胞嘧啶甲基化生成5-甲基胞嘧啶(5mC),從而產生可遺傳的表觀突變和新的表觀等位基因。這種類型的非序列變異稱為表觀遺傳學 ...

Tue Apr 12 22:28:00 CST 2022 0 617
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM