簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析
簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用於做基因差異表達分析，主要也是用於RNA-Seq數據，同樣也可以處理類似 ...
原文：limma, edgeR, deseq2,genefilter計算差異R包的foldchange方法差別
差異計算對應生信分析非常重要 limma,genefilter 包計算差異,數據一定要轉log, 因為 這兩個包計算差異使用的方法是 mean As mean Bs , 也計算是 logAmean logBmean log Amean Bmean 這也是為什么這兩個包算出來的結果直接是logfoldchange . deseq 包計算差異使用的是raw readscount,整數數據類型,計算差 ...
2020-04-10 23:55 0 992 推薦指數：
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