Error in library(DESeq2) : 不存在叫‘DESeq2’這個名字的程輯包

Error in read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 
  無法打開鏈結
此外: Warning messages:
1: In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
  downloaded length 1486848 != reported length 4243023
2: In unzip(zipname, exdir = dest) : 從zip文件中抽取1時出了錯
3: In read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) :
  無法打開壓縮文件'Biobase/DESCRIPTION'，可能是因為'No such file or directory'

在安裝‘DESeq2’這個包的最后出現上面的錯誤。可以看出是‘Biobase’這個包有問題。重新安裝此包后，再一次安裝‘DESeq2’，安裝成功。

library('DESeq2')出現下面問題：

載入需要的程輯包：GenomeInfoDb
Error: package or namespace load failed for ‘GenomeInfoDb’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
 不存在叫‘GenomeInfoDbData’這個名字的程輯包
錯誤: 無法載入程輯包‘GenomeInfoDb’

缺少GenomeInfoDb包，繼續安裝

'GenomeInfoDbData'這個包一直能完整下載，但是安裝出錯

於是，先把'GenomeInfoDbData'本地下載下來，再用R進行本地安裝，安裝成功

library(DESeq2)

成功

 

tip:包安裝不成功可能原因

1.依賴包沒有安裝，先安裝依賴包

2.下載包時，網速不行，安裝出錯。用瀏覽器下載，之后本地安裝

3.R的版本不對，檢查對應的版本