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在安裝 DESeq 這個包的最后出現上面的錯誤。可以看出是 Biobase 這個包有問題。重新安裝此包后,再一次安裝 DESeq ,安裝成功。 library DESeq 出現下面問題: 缺少GenomeInfoDb包,繼續安裝 GenomeInfoDbData 這個包一直能完整下載,但是安裝出錯 於是,先把 GenomeInfoDbData 本地下載下來,再用R進行本地安裝,安裝成功 libr ...
2017-12-06 14:44 1 7426 推薦指數:
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安裝R包(“RcppArmadillo”)失敗,導致依賴該包的DESeq2 無法使用; 首先對gcc,g++升級至4.7, 但依然報錯,還是安裝不了RcppArmadillo; 報錯如下: $ R > source("https://bioconductor.org ...
> library('ggplot2')Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 不存在叫‘colorspace’這個名字的程輯包 在安裝了某個包的時候,解決依賴關系時更新 ...
1) MA圖 對於MA圖而言, 橫坐標為該基因在所有樣本中的均值,basemean = (basemean_A + basemean_B ) / 2, ...
簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用於做基因差異表達分析,主要也是用於RNA-Seq數據,同樣也可以處理類似 ...
是為什么這兩個包算出來的結果直接是logfoldchange . deseq2 包計算差異使用的是r ...
", "Suggests"))需要安裝依賴的包全部安裝之后,就可以了。依賴包如下:dependencies ‘doMC’, ...
說明: 開發環境:IDEA+MAVEN問題:idea錯誤提示:Java:程序包xxxx不存在 解決方案: 1.確保pox.xml文件沒有報錯,即文件上面不能有條波浪線,因為有時候有波浪線的話,會導致有些包不能自動導入。使用maven自動導包2.若maven導包后還未解決問題,點擊 ...