基因型數據正負鏈怎么翻轉(snp flip)
在合並數據過程當中，經常會發現不同來源的數據正負鏈不是統一的，這是一件很頭疼的事。 正負鏈沒有統一的情況下直接合並在一起會產生什么后果呢。 舉個最簡單的例子，假如我們從小明和小紅分別拿到了一批基因型數據。那么存在以下幾種可能：1）小明的基因型數據統一好正鏈或者負鏈；2）小紅的基因型數據統一 ...
原文：illumina SNP 芯片轉基因型矩陣
一 芯片數據 此次拿到的illumina芯片數據並不是原始的數據，已經經過GenomeStudio軟件處理成了finalreport文件，格式如下： 之前沒處理過芯片數據，對於這種編碼模式 Forward，top AB 的基因型數據很疑惑，查了很多資料，收效甚微。看過建明大神對芯片這塊兒的介紹，發現里面的門門道道太多了，也有些R包可以直接處理芯片原始數據的 問題是我沒有最初的原始數據啊OTZ。最后 ...
2020-03-24 17:27 0 702 推薦指數：
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