原文:Novel LncRNA的實時定量PCR引物設計教程

Novel LncRNA的選擇 novel LncRNA選擇的原則: .不能選與其他基因exon重疊的lncRNA,否則,RT qPCR結果就混合了兩個基因的表達量。 .最好選擇基因間的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因沒有重疊。 .其次選擇位於其他基因intron區域的lncRNA。 .再次,如果lncRNA的一部分與其他基因的exon重疊,另一部分不重疊,就選不重疊的那部分。 Nov ...

2020-01-02 23:29 0 3099 推薦指數:

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Annotated LncRNA實時定量PCR引物設計教程

LncRNA設計原則 LncRNA引物設計跟mRNA的引物設計類似,都遵循以下規則: 1.引物應在核酸系列保守區內設計並具有特異性。2.擴增產物長度在 80-150bp。最長不要超過 300bp。3.產物不能形成二級結構(自由能小於 58.61KJ/mol)。4.引物長度:一般在 17-25 ...

Fri Jan 03 04:26:00 CST 2020 0 5984
lncRNA表達定量方法評估

見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense ...

Tue Mar 27 23:42:00 CST 2018 0 881
10.26-qPCR引物設計

設計原則: 1.PCR擴增產物長度 :80-150bp. 引物的產物大小不要太大,一般在80-250bp之間都可;80-150bp最為合適(可以延長至300 bp) 2.引物長度一般在15-30鹼基之間。   引物長度(primer length)常用的是18-27bp,但不應大於38bp ...

Wed Oct 27 02:08:00 CST 2021 0 4994
primer3批量設計引物

核心程序調用 Primer3_core,基本用法: primer3_core [ -format_output ] [ -default_version=1|-default_version=2 ...

Fri Aug 17 17:20:00 CST 2018 0 1673
生信-使用NCBI進行目的基因的引物設計

使用NCBI進行目的基因的引物設計 全文概述 利用生信工具進行目的基因的引物設計,使用了NCBI進行篩選與設計引物,使用 idtdna對篩選出的DNA進行檢查。本文分享了如何篩選出高質量的基因引物,幫助想通過生信進行引物設計的學生、從業者找出合適的基因,畢竟購買引物也比較燒錢,避免設計出的基因 ...

Mon Nov 25 04:11:00 CST 2019 0 336
TPM 程序設計基礎 1-2-4 :新的 PCR 命令

New PCR commands 新的 PCR 命令 注意:本文只提供相關函數的說明、定義、參數、返回值、注釋等的簡單翻譯,對於更多信息、疑問或錯誤之處,請閱讀原英文文檔。 Tspi_TPM_PcrReset 重置PCR寄存器。 《TSS V1.2.pdf》 P298 ...

Wed Apr 29 19:18:00 CST 2020 0 719
 
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