Novel LncRNA的選擇 novel LncRNA選擇的原則: 1.不能選與其他基因exon重疊的lncRNA,否則,RT-qPCR結果就混合了兩個基因的表達量。 2.最好選擇基因間的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因沒有重疊。 3.其次選擇位於其他基因intron區域 ...
LncRNA設計原則 LncRNA的引物設計跟mRNA的引物設計類似,都遵循以下規則: .引物應在核酸系列保守區內設計並具有特異性。 .擴增產物長度在 bp。最長不要超過 bp。 .產物不能形成二級結構 自由能小於 . KJ mol 。 .引物長度:一般在 鹼基之間,上下游引物不宜相差太大。 .引物自身不能有連續 個鹼基的互補,避免形成發卡結構。 LncRNA引物設計 我們通過在線工具Primer ...
2020-01-02 20:26 0 5984 推薦指數:
Novel LncRNA的選擇 novel LncRNA選擇的原則: 1.不能選與其他基因exon重疊的lncRNA,否則,RT-qPCR結果就混合了兩個基因的表達量。 2.最好選擇基因間的lncRNA,即lincRNA,跟其他基因沒有重疊。 3.其次選擇位於其他基因intron區域 ...
見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can be detected in the samples, with antisense ...
設計原則: 1.PCR擴增產物長度 :80-150bp. 引物的產物大小不要太大,一般在80-250bp之間都可;80-150bp最為合適(可以延長至300 bp) 2.引物長度一般在15-30鹼基之間。 引物長度(primer length)常用的是18-27bp,但不應大於38bp ...
核心程序調用 Primer3_core,基本用法: primer3_core [ -format_output ] [ -default_version=1|-default_version=2 ...
獲取指定基因區間序列鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000017.11 步驟一:進入NCBI主頁,左邊框中選擇Nucleotide, ...
直接上連接: http://primer3plus.com/cgi-bin/dev/primer3plus.cgi ...
使用NCBI進行目的基因的引物設計 全文概述 利用生信工具進行目的基因的引物設計,使用了NCBI進行篩選與設計引物,使用 idtdna對篩選出的DNA進行檢查。本文分享了如何篩選出高質量的基因引物,幫助想通過生信進行引物設計的學生、從業者找出合適的基因,畢竟購買引物也比較燒錢,避免設計出的基因 ...
New PCR commands 新的 PCR 命令 注意:本文只提供相關函數的說明、定義、參數、返回值、注釋等的簡單翻譯,對於更多信息、疑問或錯誤之處,請閱讀原英文文檔。 Tspi_TPM_PcrReset 重置PCR寄存器。 《TSS V1.2.pdf》 P298 ...