原文:全基因組鳥槍法測序策略(WGS)

全基因組鳥槍法測序是在獲得一定的遺傳及物理圖譜信息的基礎上,繞過bac克隆逐個排序的過程,將基因組DNA分解成 kb左右的小片段進行隨機測序,輔以一定數量的 kb的克隆和bac克隆的末端測序,利用超級計算機進行整合進行序列組裝的測序過程。 全基因組鳥槍法測序的主要步驟是: 第一,建立高度隨機 插入片段大小為 kb左右的基因組文庫。克隆數要達到一定數量,即經末端測序的克隆片段的鹼基總數應達到基因組 ...

2019-12-12 19:29 0 412 推薦指數:

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基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記WGS

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Fri Jul 02 02:01:00 CST 2021 0 204
PacBio基因組測序和組裝

PacBio公司的業務范圍也就5個(官網): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中基因組測序應該是PacBio ...

Sun Nov 27 04:15:00 CST 2016 0 1379
一個基因組測序分析實戰

Original 2017-06-08 曾健明 生信技能樹 這里選取的是 GATK best practice 是目前認可度最高的基因組測序分析流程,尤其適用於 人類研究。 PS:其實本文應該屬於直播我的基因組系列,有兩個原因把它單獨拿出來 ...

Sun Jul 02 07:49:00 CST 2017 0 10268
基因組測序及數據分析基礎

華大的春季培訓課程之一:https://ke.qq.com/course/1128997?taid=7160092735650341,我認為講得很好,介紹全面而詳細,加了一些個人經驗(侵刪)。 ...

Sun Mar 29 07:49:00 CST 2020 0 908
基因組測序 從頭測序(de novo sequencing) 重測序(re-sequencing)

基因組測序 基因組測序分為從頭測序(de novo sequencing)和重測序(re-sequencing)。 從頭測序(de novo)不需要任何參考基因組信息即可對某個物種的基因組進行測序,利用生物信息學分析方法進行拼接、組裝,獲得該物種的基因組 ...

Fri Oct 19 19:16:00 CST 2018 0 13208
基因組測序及分析

基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...

Wed Aug 02 05:39:00 CST 2017 0 1129
利用ONT測序檢測真核生物基因組甲基化狀態

摘要 甲基化在真核生物基因組序列中廣泛存在,其中5mC最為普遍,在真核生物基因組中也有發現6mA。捕獲基因組中的甲基化狀態的常用技術是基因組甲基化測序(WGBS)和簡化甲基化測序(RRBS),而隨着第三代測序技術的完善,ONT單分子納米孔測序可以從單分子的角度來檢出甲基化的胞嘧啶和腺嘌呤電流 ...

Fri Jul 09 19:07:00 CST 2021 0 260
 
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