目錄 需求 實現 需求 我有一個物種taxonomy ID的list,想獲得相應的物種名,不要一個個去NCBI Taxonomy官網查。反之根據物種名list查詢對應的taxid。 實現 因為之前沒怎么用過,我的第一個想法是通過下載到集群 ...
需求 我有一個物種taxonomy ID的list,想獲得相應的物種名,不要一個個去NCBI Taxonomy官網查。反之根據物種名list查詢對應的taxid。 實現 因為之前沒怎么用過,我的第一個想法是通過下載到集群的taxonomy數據庫文件來匹配。一般下載下來的數據庫會有names.dmp和nodes.dmp文件,分別是物種層級關系文件和taxid與物種名對應文件。但我想要的只是speci ...
2019-12-02 13:03 0 357 推薦指數:
目錄 需求 實現 需求 我有一個物種taxonomy ID的list,想獲得相應的物種名,不要一個個去NCBI Taxonomy官網查。反之根據物種名list查詢對應的taxid。 實現 因為之前沒怎么用過,我的第一個想法是通過下載到集群 ...
目錄 基本概念 代謝組學分類與應用 代謝組學研究意義與優勢 代謝組學分析流程 代謝組學常見名詞 基本概念 代謝物:所有分子量小於1500Da的小分子物質,包括糖類、核苷、有機酸、酮類化合物、多肽、氨基酸、有機胺類、醛類化合物、脂質、萜類、類固醇 ...
基本概念 代謝物:所有分子量小於1500Da的小分子物質,包括糖類、核苷、有機酸、酮類化合物、多肽、氨基酸、有機胺類、醛類化合物、脂質、萜類、類固醇、生物鹼、小分子葯物等等。 代謝組:一個細胞、組織、器官中所有代謝物的集合。 代謝組學:利用高通量的技術來鑒定和定量一個細胞、組織或器官中所有小 ...
目錄 一、iMetaLab簡介 二、內置工具與模塊 1. Data Processing module 2. Functional Analysis ...
方法: 1\打開文件 2\工具---宏----錄制新宏---輸入名字如:HACKER 3\停止錄制(這樣得到一個空宏) 4\工具---宏----宏,選HACKER,點編輯按鈕 5\刪除窗口中的所有字符(只有幾個),替換為下面的內容:(復制吧) 6\關閉編輯窗口 7\工具---宏-----宏,選 ...
宏蛋白質組數據分析相對較難,不同於常規蛋白質組分析,因為數據庫太大,無法直接進行搜庫匹配,需要對數據庫進行優化。整理了幾個發表的宏蛋白搜庫分析工具。具體效果如何,還需要測試。 1.ProteoStorm 發表:ProteoStorm: An Ultrafast Metaproteomics ...
目錄 1.實驗及質控 (1)項目流程 (2)非靶代謝質控 (3)靶向代謝質控 (4)代謝組全流程質控 2.數據分析挖掘 (1)代謝組分類回顧 (2)數據預處理 (3)定量層面挖掘 ...