原文:字符串與模式匹配算法(六):Needleman–Wunsch算法

一 Needleman Wunsch 算法 尼德曼 翁施算法 英語:Needleman Wunsch Algorithm 是基於生物信息學的知識來匹配蛋白序列或者DNA序列的算法。這是將動態算法應用於生物序列的比較的最早期的幾個實例之一。該算法是由 Saul B. Needlman和 Christian D. Wunsch 兩位科學家於 年發明的。本算法高效地解決了如何將一個龐大的數學問題分解為一 ...

2019-11-19 22:52 0 347 推薦指數:

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字符串模式匹配算法(五):BMH算法

一、BMH算法介紹   在BM算法的實際應用中,壞字符偏移函數的應用次數要遠遠超過好后綴偏移函數的應用次數,壞字符偏移函數在匹配過程中起着移動指針的主導作用。在實際匹配過程,只是用壞字符偏移函數也非常有效。1980年,奈傑爾·豪斯普(Nigel Horspool)提出了改進的BM算法,也就 ...

Mon Nov 18 07:41:00 CST 2019 0 268
字符串模式匹配算法2 - AC算法

上篇文章(http://www.cnblogs.com/zzqcn/p/3508442.html)里提到的BF和KMP算法都是單模式匹配算法,也就是說,模式只有一個。當需要在字符串中搜索多個關鍵字(模式)時,則需要用到多模式匹配算法。 簡介 AC(Aho-Corasick)算法 ...

Sun Jan 19 07:44:00 CST 2014 3 4820
算法模式匹配算法

  (又稱字符串)是由n(n≥0)個字符組成的有限序列,它是數據元素為單個字符的特殊線性表。可以用順序存儲方式或者鏈式存儲方式進行存儲。模式匹配最重要和最復雜的一個操作,其實也就是的查找,其中Brute-Force算法和KMP算法是兩種最經常使用的順序存儲結構下的模式匹配算法 ...

Thu Apr 11 23:02:00 CST 2019 0 3962
Java數據結構之字符串模式匹配算法---Brute-Force算法

模式匹配字符串匹配問題中,我們期待察看源 “ S ” 中是否含有目標T ” (也叫模式)。其中 S被稱為主T被稱為子串。 1、如果在主中查找到子串,則稱為模式匹配成功,返回模式的第一個字符在主中出現的位置。 2、如果在主中 ...

Mon Oct 31 01:31:00 CST 2016 0 5307
字符串模式匹配算法1 - BF和KMP算法

字符串S中定位/查找某個子字符串P的操作,通常稱為字符串模式匹配,其中P稱為模式模式匹配有多種算法,這里先總結一下BF算法和KMP算法。 注意:本文在討論字符位置/指針/下標時,全部使用C語法,即下標從0開始。 BF算法 BF(Brute Force)算法也就是傳說中的“笨辦法 ...

Wed Jan 08 02:49:00 CST 2014 0 11085
Java數據結構之字符串模式匹配算法---KMP算法

本文主要的思路都是參考http://kb.cnblogs.com/page/176818/ 如有冒犯請告知,多謝。 一、KMP算法   KMP算法可以在O(n+m)的時間數量級上完成串的模式匹配操作,其基本思想是:每當匹配過程中出現字符串比較不等時,不需回溯指針,而是利用已經得到的“部分匹配 ...

Mon Nov 14 04:22:00 CST 2016 0 2382
字符串模式匹配算法系列(一):BF算法

算法背景: BF(Brute Force)算法,是一種在字符串匹配算法中,比較符合人類自然思維方式的方法,即對源字符串和目標字符串逐個字符地進行比較,直到在源字符串中找到完全與目標字符串匹配的子字符串,或者遍歷到最后發現找不到能匹配的子字符串算法思路很簡單,但也很暴力。 算法原理: 假設 ...

Thu Jul 25 00:33:00 CST 2019 0 1372
模式匹配算法---RK

這一節介紹一下由Rabin和Karp提出的RK算法。 1,RK算法的基本思想 HASH! 如果兩個字符串hash后的值不相同,則它們肯定不相同;如果它們hash后的值相同,它們不一定相同。 RK算法的基本思想就是:將模式P的hash值跟主S中的每一個長度 ...

Fri May 25 05:43:00 CST 2012 0 6809
 
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