單細胞測序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在過去的十多年里,高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域,極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄組測序(RNA-seq)被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄 ...
原文地址:https: doi.org . s y scSLAM seq reveals core features of transcription dynamics in single cells 摘要 單細胞轉錄組測序 single cell RNA seq, scRNA seq 強調了細胞間表達異質性在健康和疾病表型變異中的重要作用。然而,目前的scRNA seq方法僅僅提供了基因表達的 ...
2019-10-25 23:01 0 333 推薦指數:
單細胞測序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在過去的十多年里,高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域,極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄組測序(RNA-seq)被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄 ...
方法:MALBAC方法及MDA方法,而單細胞轉錄組目前主要有三種方法:SMART擴增技術、10×gen ...
實驗室馬上要開始做heart的單細胞空間轉錄組,需要提前了解一下基本的data。 廢話不多說,先把示例數據和教程跑一遍,找找感覺。 參考:Seurat4.0系列教程22:空間轉錄組的分析、可視化與整合 樣本制備 - 獲取高質量數據的前提 參考 ...
一句話評價:小樣本量單細胞轉錄組在冷門疾病領域應用前景尚可,常規套路也能發NC 1. Title 標題可以看出本研究的主要內容:①構建成纖維細胞的圖譜/揭示成纖維細胞的異質性;②找到一群(相對於正常樣本)在纖維化皮膚病中含量升高的間充質成纖維細胞 2. Background ...
什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...
自從2009年單細胞轉錄組測序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scRNA-seq技術相繼被開發出來。在過去的十年里,單細胞轉錄組測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因組范圍內所有基因的表達情況,可以更精准的開展 ...
單細胞測序技術是指在單個細胞水平上對轉錄組或基因組進行擴增並測序,以檢測單細胞在基因組(結構變異-Structural Variations-SVs;拷貝數變異-Copy number variants-CNVs;單核苷酸變異-Single nucleotide variants-SNVs ...
單細胞流程跑了不少,但依舊看不懂結果,是該好好補補了。 有些人可能會誤會,覺得單細胞的RNA-seq數據很好分析,跟分析常規的RNA-seq應該沒什么區別。今天的這篇文章2015年3月發表在Nature Genetics Review上,專門說明了一下單細胞RNA測序數據在數據分析和計算 ...