Seurat | 單細胞分析工具
Seurat是一個老牌的單細胞分析工具了（satija的力作），我之前測試過，但是沒怎么用。 最近發現這個工具又publish在了NBT上，所以很有必要看一下這篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...
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單細胞測序學習（二）
三、單細胞測序原理 今天主要介紹單細胞測序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前單細胞測序的兩大主流平台，所以今天的單細胞測序原理介紹也是基於這兩個平台的。 （1）10X Genomics單細胞測序原理 上圖是10X單細胞測序的原理圖。首先要 ...
單細胞測序的知識
單細胞測序的知識 劉小澤 已關注 2018.07.20 21:33* 字數 1885 閱讀 675評論 0喜歡 7 劉小澤寫於18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...
【代碼更新】單細胞分析實錄(21): 非負矩陣分解(NMF)的R代碼實現，只需兩步，啥圖都有
1. 起因 之前的代碼(單細胞分析實錄(17): 非負矩陣分解(NMF)代碼演示)沒有涉及到python語法，只有4個python命令行，就跟Linux下面的ls grep一樣的。然鵝，有幾個小伙伴不會命令行，所以我決定再改寫一下，把命令行都放到R下面運行。 2. 嘗試 2.1 一開始 ...
單細胞中的細胞類型划分
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《單細胞生物》教學反思
第12周學校開展“師徒共上一節課”活動，我們選的課題是《單細胞生物》，本節內容是在學習了植物細胞的結構、動物細胞結構及細胞生活的基礎上，讓學生知道生物體有多細胞的動物體和植物體以外，告訴學生生物體也有單細胞的，它們沒有復雜的結構，是否與多細胞生物體一樣，能夠獨立完成各項生命活動呢？因此，第四節 ...