實驗室馬上要開始做heart的單細胞空間轉錄組,需要提前了解一下基本的data。 廢話不多說,先把示例數據和教程跑一遍,找找感覺。 參考:Seurat4.0系列教程22:空間轉錄組的分析、可視化與整合 樣本制備 - 獲取高質量數據的前提 參考 ...
單細胞測序流程 http: learn.gencore.bio.nyu.edu 在過去的十多年里,高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域,極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄組測序 RNA seq 被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄本的表達情況。但傳統的轉錄組測序技術 bulk RNA seq 是基於群體細胞,每個樣本包含成千上萬個細胞,所以最終反映的是基因在群體細胞中平均表達水 ...
2019-09-07 15:23 0 1442 推薦指數:
實驗室馬上要開始做heart的單細胞空間轉錄組,需要提前了解一下基本的data。 廢話不多說,先把示例數據和教程跑一遍,找找感覺。 參考:Seurat4.0系列教程22:空間轉錄組的分析、可視化與整合 樣本制備 - 獲取高質量數據的前提 參考 ...
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 單細胞測序主要涉及單細胞基因組測序和轉錄組測序兩個方面,分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學家關注的一個熱點。單細胞基因組測序目前主要有兩種擴增 ...
本文總結自一篇綜述: Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 單細胞分析分為兩個層次: cell level gene level Tools for the visualization ...
自從2009年單細胞轉錄組測序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scRNA-seq技術相繼被開發出來。在過去的十年里,單細胞轉錄組測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因組范圍內所有基因的表達情況,可以更精准的開展 ...
單細胞測序技術是指在單個細胞水平上對轉錄組或基因組進行擴增並測序,以檢測單細胞在基因組(結構變異-Structural Variations-SVs;拷貝數變異-Copy number variants-CNVs;單核苷酸變異-Single nucleotide variants-SNVs ...
單細胞RNA測序技術之入門指南 【字體: 大 中 小 】 時間:2018年09月12日 來源:生物通 編輯推薦: 在這個飛速發展的測序時代,DNA和RNA測序已經逐漸成為“實驗室中的家常菜”。若要評選出目前最受歡迎的一道菜,那恐怕非單細胞RNA測序莫屬 ...
在有些情況下,細胞是很難完整分離的,比如長期保存的組織,或者大腦細胞和脂肪細胞。在分離細胞時所用的酶和破壞力往往會影響其他細胞區室的內容。此時,單核RNA測序就顯得特別重要。 細胞核轉錄組是否代表了整個細胞的轉錄組,以及在snRNA-seq中發現的基因是否或多或少與特定研究相關。一些比較單細胞 ...
單細胞測序技術(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 來源: 一呼百諾 點擊次數:6587關鍵詞: 前言 單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這 ...