原文:pheatmap繪制“熱圖”,你需要的都在這

熱圖可以聚合大量的數據,並可以用一種漸進色來優雅地表現,可以很直觀地展現數據的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語言pheatmap包從頭開始繪制各種漂亮的熱圖。參數像積木,拼湊出你最喜歡的熱圖即可,如下圖: 基因和樣本都可以單獨聚類,排序,聚類再分組,行列注釋,配色調整,調整聚類線以及單元格的寬度和高度均可實現。 載入數據,R包 R包library pheatmap 構建測試數據 set.seed ...

2019-07-30 13:52 0 10680 推薦指數:

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R語言 繪制 pheatmap

pheatmap實際上是 Pretty Heatmaps 的縮寫,簡單地來說,一個可以傻瓜式繪制聚類的R包。常用參數介紹基礎設置main 的名字file 要保存的名字color 表示顏色,賦值漸變顏色調色板colorRampPalette屬性,選擇“綠,黑,紅”漸變,分為100個等級,,例 ...

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Muzli – 所有你需要的設計靈感都在這

  曾幾何時,三個家伙一起工作,他們分享各種令人振奮的資源鏈接。然后,其中一個人有一個想法。一個絕妙的主意,是否可以有一種方式來與他人分享這些鏈接?因此, Muzli 誕生了。所有你需要的設計靈感這里都有,趕緊體驗吧。 不錯!去看看   您可能感興趣的相關文章 ...

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主要步驟 pheatmap 數據處理成矩陣形式,給行名列名 用pheatmappheatmap函數內部用hclustfun 進行聚類) ggplot2 數據處理成矩陣形式,給行名列名 hclust聚類,改變矩陣行列順序為聚類后的順序 melt數據,處理 ...

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