pheatmap實際上是 Pretty Heatmaps 的縮寫,簡單地來說,一個可以傻瓜式繪制聚類熱圖的R包。常用參數介紹基礎設置main 圖的名字file 要保存圖的名字color 表示顏色,賦值漸變顏色調色板colorRampPalette屬性,選擇“綠,黑,紅”漸變,分為100個等級,,例 ...
熱圖可以聚合大量的數據,並可以用一種漸進色來優雅地表現,可以很直觀地展現數據的疏密程度或頻率高低。 本文利用R語言pheatmap包從頭開始繪制各種漂亮的熱圖。參數像積木,拼湊出你最喜歡的熱圖即可,如下圖: 基因和樣本都可以單獨聚類,排序,聚類再分組,行列注釋,配色調整,調整聚類線以及單元格的寬度和高度均可實現。 載入數據,R包 R包library pheatmap 構建測試數據 set.seed ...
2019-07-30 13:52 0 10680 推薦指數:
pheatmap實際上是 Pretty Heatmaps 的縮寫,簡單地來說,一個可以傻瓜式繪制聚類熱圖的R包。常用參數介紹基礎設置main 圖的名字file 要保存圖的名字color 表示顏色,賦值漸變顏色調色板colorRampPalette屬性,選擇“綠,黑,紅”漸變,分為100個等級,,例 ...
曾幾何時,三個家伙一起工作,他們分享各種令人振奮的資源鏈接。然后,其中一個人有一個想法。一個絕妙的主意,是否可以有一種方式來與他人分享這些鏈接?因此, Muzli 誕生了。所有你需要的設計靈感這里都有,趕緊體驗吧。 不錯!去看看 您可能感興趣的相關文章 ...
1. 智能垃圾回收小程序 智能垃圾回收小程序,支持拍照識別、語音錄入識別,包含垃圾分類題庫測試。 雲開發版:使用小程序雲開發,無需單獨搭建服務器。 java后台版: 帶網頁管理頁面,使用java ...
和target_layer_name即可,若是多流的,則需要根據自己的實際情況debug,代碼不長,比 ...
經常會想到用熱圖來展示某個基因或某些基因的表達量問題,今天用R中pheatmap包一步步繪制熱圖。 第一步:公眾路徑設置,調用包pheatmap,讀取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入繪制熱圖(圖1-圖15) 一建熱圖(圖1) p<-pheatmap(data ...
主要步驟 pheatmap 數據處理成矩陣形式,給行名列名 用pheatmap畫熱圖(pheatmap函數內部用hclustfun 進行聚類) ggplot2 數據處理成矩陣形式,給行名列名 hclust聚類,改變矩陣行列順序為聚類后的順序 melt數據,處理 ...
DEL key [key ...]刪除指定的key(一個或多個) DUMP key導出key的值 EXISTS key [key ...]查詢一個key是否存在 EXPIRE key ...
、哈希函數、哈希表。 這三者有什么樣的愛恨情仇? 為什么Object類中需要有一個hashCode ...