GATK的pipeline使用WDL進行編寫 WDL是一種流程管理語言,內置的支持並行,適合編寫pipeline 運行wdl腳本需要兩步:第一步編輯參數列表對應的json文件,第二步直接運行Cromwell.jar eg 對於一個WDL腳本,有5個核心 ...
WDL是什么 WDL是由Broad Institute開發的一種流程開發語言,全稱workflow description language,官方鏈接如下:https: software.broadinstitute.org wdl WDL的編寫 WDL有自己的語法規范,它是一種描述性語言,可讀性很高。 每種語言都有自己的hello world,WDL也不例外,示例如下圖 WDL可以分為兩個部分t ...
2019-07-08 15:21 0 1480 推薦指數:
GATK的pipeline使用WDL進行編寫 WDL是一種流程管理語言,內置的支持並行,適合編寫pipeline 運行wdl腳本需要兩步:第一步編輯參數列表對應的json文件,第二步直接運行Cromwell.jar eg 對於一個WDL腳本,有5個核心 ...
WDL中文教程 原文連接:https://github.com/openwdl/wdl/blob/main/versions/1.1/SPEC.md#workflow-description-language-wdl 該教程基於工作流描述語言(Workflow Description ...
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