原文:單細胞中的細胞類型划分

cell type classify .caret,.dropup .btn .caret border top color: important .label border: px solid .table border collapse:collapse important .table td,.table th background color: fff important .table b ...

2019-03-14 20:13 0 814 推薦指數:

查看詳情

單細胞分析實錄(7): 差異表達分析/細胞類型注釋

前面已經講解了: 單細胞分析實錄(1): 認識Cell Hashing 單細胞分析實錄(2): 使用Cell Ranger得到表達矩陣 單細胞分析實錄(3): Cell Hashing數據拆分 單細胞分析實錄(4): doublet檢測 單細胞分析實錄(5): Seurat標准流程 單細胞 ...

Fri Jan 08 02:43:00 CST 2021 3 3438
單細胞測序學習(一)

一、單細胞測序簡介   單細胞測序技術(single cell sequencing)是指在單個細胞水平上,對基因組、轉錄組、表觀組進行高通量測序分析的一項新技術,它能夠彌補傳統高通量測序的局限性,揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態,反映細胞間的異質性。   我們經常看到的scRNA-seq ...

Thu Oct 29 17:13:00 CST 2020 0 658
單細胞測序學習(二)

三、單細胞測序原理   今天主要介紹單細胞測序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前單細胞測序的兩大主流平台,所以今天的單細胞測序原理介紹也是基於這兩個平台的。  (1)10X Genomics單細胞測序原理         上圖是10X單細胞測序的原理圖。首先要 ...

Thu Oct 29 17:19:00 CST 2020 0 1281
單細胞測序的知識

單細胞測序的知識 劉小澤 已關注 2018.07.20 21:33* 字數 1885 閱讀 675評論 0喜歡 7 劉小澤寫於18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...

Sat Oct 20 04:02:00 CST 2018 0 1917
單細胞分析實錄(14): 細胞類型注釋的另一種思路 — CellID

之前寫過一篇細胞類型注釋的推文:單細胞分析實錄(7): 差異表達分析/細胞類型注釋,里面介紹了細胞類型注釋的兩種思路。在談到自動注釋時,我們基本都會用SingleR這個軟件,類似的軟件還有很多,原理上可能五花八門,但表現不一定有SingleR好。很多軟件在做注釋時會基於某個細胞和參考細胞表達譜 ...

Fri May 28 07:17:00 CST 2021 0 344
Seurat | 單細胞分析工具

Seurat是一個老牌的單細胞分析工具了(satija的力作),我之前測試過,但是沒怎么用。 最近發現這個工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下這篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...

Mon Jun 04 19:09:00 CST 2018 0 2724
單細胞生物》教學反思

第12周學校開展“師徒共上一節課”活動,我們選的課題是《單細胞生物》,本節內容是在學習了植物細胞的結構、動物細胞結構及細胞生活的基礎上,讓學生知道生物體有多細胞的動物體和植物體以外,告訴學生生物體也有單細胞的,它們沒有復雜的結構,是否與多細胞生物體一樣,能夠獨立完成各項生命活動呢?因此,第四節 ...

Mon Jun 10 16:31:00 CST 2019 0 462
單細胞測序技術 概述

單細胞測序技術是指在單個細胞水平上對轉錄組或基因組進行擴增並測序,以檢測單細胞在基因組(結構變異-Structural Variations-SVs;拷貝數變異-Copy number variants-CNVs;單核苷酸變異-Single nucleotide variants-SNVs ...

Sun Jun 27 18:29:00 CST 2021 0 565
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM