原文:WGCNA-cytoscape-analysis

全套R代碼復刻: WGCNA installsource https: bioconductor.org biocLite.R biocLite c AnnotationDbi , impute , GO.db , preprocessCore install.packages c matrixStats , Hmisc , splines , foreach , doParallel , fas ...

2019-03-11 17:39 0 1499 推薦指數:

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詳解WGCNA

建議查資料來源: 1、 微信搜索,很多公眾號寫的比較全 2、 CSDN代碼解讀比較好,相關小點也說的比較好。報錯代碼一部分也能查到。 3、 博客園 4、 簡書 5、 谷歌 一、了解到底什么是WGCNA。 先通讀了解相關概念。先不要去糾結代碼。看最基礎的概念就好,實在 ...

Tue Sep 03 05:26:00 CST 2019 0 1064
WGCNA算法研究筆記

Network Analysis中文名有翻譯成加權關聯網絡分析的,感覺不是很恰當,英文來得比較直接。本來是佟昊從老 ...

Sat Apr 04 06:52:00 CST 2015 0 5288
安裝cytoscape時的折騰

問題: 安裝cytoscape時,提示: error信息: No suitable Java Virtual Machine could be found on your system.The version of the JVM must be at least 1.8.0_152 ...

Fri Nov 22 20:07:00 CST 2019 0 2291
STRING Cytoscape 網絡互作圖

網絡圖(Network)看似復雜,其實構成非常簡單,網絡圖是一種圖解模型,形狀如同網絡,故稱網絡圖,由節點(node)和連線(edge)兩個因素組成的。其中 node 又分為 source node( ...

Tue Aug 27 19:06:00 CST 2019 1 5927
Cytoscape軟件簡介

•  Cytoscape一款開源的網絡顯示和分析軟件。    軟件的核心部分提供了 網絡顯示、布局、查詢等方面的基本功能。 •  Cytoscape源自系統生物學,通過Cytoscape,用戶可以在可視化的 環境下將這些生物網絡跟基因表達、    基因型等各種分子狀態信息整合 在一起,還能 ...

Mon Jul 29 03:44:00 CST 2019 0 647
cytoscape.js 教程

因為數據要展示雙向關系,最終選用了cytoscape.js。 效果如圖,echarts只能顯示單項數據關系。 據我理解,這個插件分兩種,一種是基於jquery的,另一種是原聲的。 基於jquery是加在jquery對象上的。因為基於jquery的無法在線上顯示關系。最終選擇 ...

Wed Jun 12 22:08:00 CST 2019 1 3679
Cytoscape.js

let cy = cytoscape({ // initial viewport state: zoom: 1, // 圖表的初始縮放級別.可以設置options.minZoom和options.maxZoom設置縮放級別的限制. pan: {x: 0, y ...

Wed Dec 02 17:46:00 CST 2020 0 391
Cytoscape基礎教程筆記

昨天開始學用Cytoscape,其tutorial分為兩個部分,基礎的和高級 的。基礎教程又分成了四課:Getting Started、Filters & Editor、Fetching External Data和Expression Analysis。為防忘記,做個摘記。 第一課 ...

Fri Jul 19 01:37:00 CST 2019 0 1450
 
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