Bedtools genomecov 計算覆蓋度
簡單說明： 從2.28.0版開始，bedtools使用htslib庫支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默認所有的輸入文件都以TAB鍵分割 除非使用-sorted選項，b ...
原文：如何計算每個基因的覆蓋度與深度
如何計算每個基因的覆蓋度與深度，有多種方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 . 數據下載 . Fastq文件下載 從NCBI下載Illumina Hiseq X Ten平台的RNA Seq數據SRR 信息如上圖所示。 . . 使用wget命令 sra toolkit工具下載太慢 下載 wget ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov sra sra inst ...
2018-08-26 09:57 0 3027 推薦指數：
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