基因結構分為:啟動子區,編碼區,終止子區 編碼區包括內含子和外顯子,其中內含子在mRNA修飾的時候,會被剪切,最終,蛋白質由外顯子mRNA翻譯而成。 啟動子區的功能是結合轉錄因子,促進轉錄,如果啟動子區發生突變,有可能造成轉錄因子無法結合,從而導致基因低表達甚至不表達。 編碼區中,外顯子 ...
基因結構分為:啟動子區,編碼區,終止子區 編碼區包括內含子和外顯子,其中內含子在mRNA修飾的時候,會被剪切,最終,蛋白質由外顯子mRNA翻譯而成。 啟動子區的功能是結合轉錄因子,促進轉錄,如果啟動子區發生突變,有可能造成轉錄因子無法結合,從而導致基因低表達甚至不表達。 編碼區中,外顯子 ...
做了好久的RNA-seq分析,基因表達也在口頭溜了幾年了,但似乎老是浮在表面。 對一件事的了解程度決定了你的思維深度,只想做技工就不用想太多,想做大師就一定要刨根問底。 老是說基因表達,那么什么是基因表達?我們測序得到的基因表達其實只是一種表型,是樣本的一個快照,和普通的身高體重之類的連續型 ...
隨着人類基因組計划(Human Genome Project)即全部核苷酸測序的即將完成,人類基因組研究的重心逐漸進入后基因組時代(Postgenome Era),向基因的功能及基因的多樣性傾斜。通過對個體在不同生長發育階段或不同生理狀態下大量基因表達的平行分析,研究相應基因在生物體內的功能,闡明 ...
如何獲取hg19的CDS、UTR、intergenic、intron等的位置信息? 參考手冊: Hg19 regions for Intergenic, Promoters, Enhance ...
背景:16SrRNA 基因通常作為分子標記進行微生物群落結構的研究,但是它有一些明顯的限制,比如16S rRNA基因在物種中會有多個拷貝,而且,由於16S rRNA基因的進化速率較慢,在物種間保守,會存在多個物種的基因完全相同的情況,而且由於基因水平轉移的發生,即使親緣關系較遠的物種,也可能出現 ...
看文獻的時候,發現了g:Profiler這個寶藏工具,測試了一下,使用起來超級方便、好用,一定要分享給大家~ g:Profiler網址: https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/ 下面具體講一下該網站的功能。 1、GO 功能富集分析 功能富集分析包括:Gene ...
一直都搞不清楚這兩者的具體區別。 其實初學者搞不清楚很正常,因為它們的本質是相通的,都是對基因進行歸類注釋的數據庫。 建議初學者自己使用一下這兩個數據庫,應該很快就能明白其中的區別。 以下以一個案例來詳細說明兩者的區別: 推薦一個沒有任何基礎的人都能使用的gene set注釋工具 ...
做RNA-seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料:【3D演示】基因的表達(原版+字幕版) 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA ...